EGEE-II INFSO-RI-031688 Enabling Grids for E-sciencE www.eu-egee.org EGEE and gLite are registered trademarks Белов Сергей belov@jinr.ru Кутовский Николай.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
EGEE-II INFSO-RI Enabling Grids for E-sciencE Базовые операции в DMS gLite (практическая часть) Олешко С.Б. Петербургский институт.
Advertisements

Enabling Grids for E-sciencE GILDA Grid Demonstrator Олешко Сергей Петербургский институт ядерной физики РАН.
Архитектура LCG Ткачев Игорь ОИЯИ, Дубна, Россия 16 мая 2006 г.
GLite - EGEE middleware 22/12/2004, PNPI, Gatchina А. Кирьянов ОИТА ПИЯФ.
EGEE-II INFSO-RI Enabling Grids for E-sciencE Система управления данными в gLite Олешко С.Б. Петербургский институт ядерной физики.
Соловьев Владимир Михайлович Полномасштабное распределенное хранилище данных национальной нанотехнологической сети В 2009 г.
Что такое связи между таблицами В реляционной базе данных связи позволяют избежать избыточности данных. Например, в ходе создания базы данных, содержащей.
К построению и контролю соблюдения политик безопасности распределенных компьютерных систем на основе механизмов доверия А. А. Иткес В. Б. Савкин Институт.
Сетевые службы Для конечного пользователя сеть это не компьютеры, кабели и концентраторы и даже не информационные потоки, для него сеть это, прежде всего,
GridCom, Grid Commander – графическая оболочка для работы с задачами и данными в Гриде Галактионов В.В. ОИЯИ, Дубна.
Файловые архивы Internet Файловые архивы Internet Протокол FTP Протокол FTP Режимы обмена данными Режимы обмена данными Программное обеспечение доступа.
База данных (БД) – Совокупность определённым образом организованной информации на определённую тему (в рамках определённой предметной деятельности); Организованная.
Основные виды ресурсов и возможности их разделения.
Учитель информатики Трашков О.Л.. Для оперативного обмена информацией и совместного использования общих ресурсов компьютеры объединяют в сеть. Ресурсами.
Файлы и файловая система Шинкаренко Евгений Александрович МОУ Гимназия 2 г. Черняховск Калининградской области.
1. Теоретические основы операционных систем (планирование заданий и использования процессора, обеспечение программ средствами коммуникации и синхронизации,
22 декабря 2006 г. 1Рабочее совещание ATLAS Проведение анализа данных ATLAS с применением программы GANGA Шиякова Мария Маринова НЭОВП - ATLAS.
Файловая система 1.Файлы. Имена файлов 2.Соглашение Длинные имена файлов 4.Каталоги 5.Файловые операции 1 Разработала: учитель информатики СОШ 2.
СУБД Microsoft Access 2003 ЗНАКОМСТВО. Что такое Access? Access – Приложение, входящее в состав пакета Microsoft Office (разработано компанией Microsoft).
Администрирование ИС Администрирование DNS. Установка сервера DNS DNS-сервер представляет собой дополнительную компоненту операционной системы Windows.
Транксрипт:

EGEE-II INFSO-RI Enabling Grids for E-sciencE EGEE and gLite are registered trademarks Белов Сергей Кутовский Николай Управление данными в gLite

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Введение Предпосылки: пользователи и программы являются источником и потребителем данных основным экземпляром данных принят файл (мы работаем с файлами, а не с объектами или реляционными таблицами данные = файлы Файлы: в основном записываются один раз, читаются многократно размещены на Элементах Хранения - Storage Elements (SEs) могут существовать несколько реплик одного файла на различных сайтах доступны для пользователей Грид отовсюду местоположение м.б. определено WMS (data requirements в JDL) Также… WMS может пересылать небольшой объём данных с заданием или от выполненного задания: Input and Output Sandbox файлы могут копироваться с локальной файловой системы (WNs, UIs) в Грид (SEs), и наоборот

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Сервисы gLite API Access Workload Mgmt Services Computing Element Workload Management Metadata Catalog Data Management Storage Element Data Movement File & Replica Catalog Authorization Security Services Authentication Information & Monitoring Information & Monitoring Services Application Monitoring Connectivity Accounting Auditing Job Provenance Package Manager CLI Available gLite Implementation Service Discovery

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Сервисы DMS Storage Element – общий интерфейс к ресурсам памяти Storage Resource Manager Castor, dCache, DPM, … Native Access protocols rfio, dcap Transfer protocols gsiftp I/O Servers – обеспечивает POSIX I/O для пользователя gLite-I/O Catalogs – определение местоположения файлов File Catalog Replica Catalog LCG File Catalog (LFC) File Authorization Service Metadata Catalog AMGA Metadata Catalog File Transfer – управляемая надёжная передача файлов Data Scheduler (в разработке) File Transfer Service gLite FTS (обеспечивает физическую передачу) File Placement Service gLite FPS (взаимодействие FTS и каталогов способом транзакций)

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Требования к gLite SE Storage Element - это сервис, который позволяет пользователю или приложению сохранять данные для будущего использование Управление локальными ресурсами памяти (диски) и интерфейс к Mass Storage Systems (ленты), таким как –HPSS, CASTOR, DiskeXtender (UNITREE), … Способность управлять различными системами хранения данных единым способом и прозрачно для пользователя (обеспечивается через SRM интерфейс) Поддержка основных протоколов передачи данных –GridFTP обязательно –Другие по возможности (RFIO, dCache, DPM, https, ftp, etc…) Поддержка привычного протокола доступа для ввода/вывода удалённых файлов –POSIX (like) I/O client library for direct access of data (GFAL) Все данные на SE должны считаться данными только для чтения. Поэтому они не могут быть изменены, кроме как удалены или замещены. Различные виртуальные организации могут использовать разные политики управления квотами на пространство SE.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Протоколы передачи данных в gLite (1/2) Протоколы передачи и доступа к данным, поддерживаемые в gLite, приведены в таблице ниже. GSIFTP предоставляет функциональность FTP протокола, но с поддержкой Grid Security Infrastructure (GSI). Этот протокол ответственен за быструю, безопасную и эффективную передачу файлов с/на SE. Он дает возможность управлять передачей файлов между двумя удаленными по отношению клиенту элементами хранения данных (third-party transfers), также как и передавать данные в несколько параллельных потоков. Кажды SE имеет, как минимум, один GridFTP сервер (т.е. сервер с поддержкой протокола gsiftp). Каждый SE в инфраструктуре EGEE имеет как минимум один GridFTP- сервер, т.е. сервер, который поддерживает протокол gsiftp.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Протоколы передачи данных в gLite (2/2) В настоящее время в gLite для прямого доступа к файлам на удаленном SE используются такие протоколы, как Remote File Input/Output (RFIO) и GSI dCache Access Protocol (gsidcap). RFIO был разработан для работы с ленточными системами хранения данных (например, CERN Advanced STORage manager, CASTOR) и имеет реализации как с поддержкой безопасности (secure RFIO), так и без нее (insecure RFIO). gsidcap – это оригинальный протокол dCache (dcap) с поддержкой безопасности GSI. dCache - дисковая система хранения данных. File-протокол использовался в прошлом для локального доступа к файлам на сетевых файловых системах. В настоящий момент он больше не поддерживается и используется только для указания файла на локальной машине (например, на UI или WN), но не для записи на SE.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Типы SE в gLite (1/2) Classic SE: состоит из GridFTP сервера и обслуживающего один диск или дисковый массив демона с протоколом insecure RFIO. Скоро этот тип SE перестанет поддерживаться. CASTOR: система массовой памяти с кэширующими дисками и ленточным носителем. Виртуальная файловая система (пространство имен, namespace) избавляет пользователя от всей сложности организации дисков и лент, лежащей с основе таких систем. Миграция файла между диском и лентой происходит под управлением процесса, называемого stager. Доступ к данным осуществляется по протоколу insecure RFIO. Т.к. этот протокол является незащищенным, то доступ по нему разрешается только из той же сети, где находиться сам SE. С определёнными модификациями дисковый буфер CASTOR может использоваться в качестве дисковой системы хранения данных. dCache: состоит из сервера и одного или нескольких пулов узлов. Сервер - это единственная точка доступа ко всему SE и формирует из файлов на дисковых пулах единое дерево виртуальной файловой системы. Узлы с дисками можно динамически добавлять в пул. Доступ к данным по протоколу gsidcap организовыван по типу POSIX. dCache широко используется как в чисто дисковых системах, так и в качестве дискового буфера ко многим ленточным системам хранения данных.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Типы SE в gLite (2/2) LCG Disk pool manager: является менеджером дисковых пулов (DPM), подходящим для относительно малых грид-сайтов (до 10 Тб общего дискового пространства). Диски можно динамически добавлять в пул в любое время. Как в dCache и CASTOR, виртуальная файловая система скрывает от пользователя всю сложность архитектуры дисковых пулов. Защищенный протокол RFIO предоставляет доступ к файлам отовсюду.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI SRM-интерфейс Менеджер ресурсов хранения данных (Storage Resource Manager, SRM) является реализаций единого интерфейса (через соответствующий SRM- протокол) для операций с дисковыми и ленточными ресурсами хранения данных. Любой тип SE, за исключением морально устаревающего Classic SE, имеет собственный SRM-интерфейс. SRM скрывает от пользователя всю сложность организации ресурсов хранения данных и предоставляет ему единый набор команд для операций с данными, практически независящими от типа SE. Последние версии SRM (v2.2) предоставляет возможность запрашивать данные, хранить их на дисковом буфере определенное время, резервировать место для ожидаемых данных и т.д. Также с помощью SRM пользователь может передавать данные между двумя удаленными по отношению к клиенту элементами хранения данных Важно упомянуть, что SRM - это протокол управления данными на/между SE, а не протокол передачи самих данных. Например, задача не может считывать данные из файла в режиме реального времени с SE по SRM- протоколу.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Пример Она запускает задачу, которой нужны: данные реконструкции физического события данные симуляции некоторые файлы с данными анализа Результаты также должны быть где-то сохранены В JINR на dCache В Fermilab на дисковом массиве В PNPI на classic SE

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI SRM dCache Собственная система, свой протокол и параметры Castor Нет связи с dCache или classic SE gLite DPM Система, независимая ни от dCache ни от Castor Как пользователь, вы должны знать все эти системы!!! SRM Я общаюсь с ними от вашего имени Я буду выделять место для ваших файлов И я буду использовать протоколы передачи данных, чтобы пересылать ваши файлы туда

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Storage Resource Management Данные хранятся на disk pool servers или Mass Storage Systems Управление этими ресурсами должно обеспечивать: Прозрачный доступ к файлам (migration to/from disk pool) Выделение места для файлов (Space reservation) Получение информации о статусе файлов (File status notification ) Управление временем жизни файлов (Life time management) SRM (Storage Resource Manager) сервис реализует все эти требования: SRM это Грид сервис, который реализует взаимодействие с локальными ресурсами хранения данных и обеспечивает Грид-интерфейс для внешнего мира SRM – это протокол управления ресурсами хранения данных, а не протокол доступа к файлам или протокол передачи файлов. SRM разработан, чтобы служить единым интерфейсом для управления дисковыми (или ленточными) ресурсами. В gLite взаимодействие с SRM обычно скрыто за сервисами более высокого уровня (DM tools и APIs)

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Поддерживаемые протоколы Протоколы доступа к файлам в gLite SE 3.1: ПротоколТипGSIОписание GSIFTP(GridFTP) Передача файловДаАналог FTP gsidcap ( GSI dCache Access Protocol ) Ввод/выводДаУдалённый доступ insecure RFIO ( Remote File Input/Output Protocol ) Ввод/выводНетУдалённый доступ secured RFIO (gsirfio) Ввод/выводДаУдалённый доступ * Протокол file сейчас используется только для доступа к файлам на локальном компьютере (т.е. на UI или WN), но не к файлам на Грид SE ** GridFTP сейчас является обязательным для каждого из типов SE, поддерживаемых в gLite и основным для передачи файлов в Грид.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Имена файлов в gLite (1/3) Grid Unique ID (GUID) однозначно определяет файл в Грид: guid: Например: guid:38ed3f60-c402-11d7-a6b0-f53ee5a37e1d Logical File Name (LFN) – логическое имя файла, которое можно использовать для ссылки на файл вместо GUID (и которое, как правило, является более распространенным способом ссылки на файл). Оно имеет следующий формат: lfn: Например: lfn:importantResults/Test1240.dat В файловом каталоге (LCG File Catalog, LFC) логические имена файлов организваны в иерархическую структуру, на подобие дерева папок на диске. В этом случае формат будет такой: lfn:/grid/ / /

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Имена файлов в gLite (2/3) Storage URL (SURL), также известный как Physical File Name (PFN), определяет реплику (копию) файла на элементе хранения данных. Общий формат: :// / где префикс sfn используется для файлов, которые находятся на SE, не имеющем SRM-интерфейса, а префикс srm – для имеющих таковой. В случае sfn-префикса, строка, идущая за именем машины, указывает на местонахождение файла и может быть разделена на 1) путь к области хранения данных на самом SE (т.н. точка доступа), 2) относительный путь к виртуальной организации владельца файла и 3) относительный путь к файлу. sfn:// Например: sfn://tbed0101.cern.ch/data/dteam/doe/file1 Для SE, имеющих SRM-интерфейс, SURL не будет иметь какой-то конкретный формат, отличный от srm-префикса и имени машины. В общем случае, такие элементы хранения данных могут использовать виртуальную файловую систему и имя, которое получает файл, может не иметь ничего общего с его физическим местоположением на SE, которое тоже может меняться со временем. Например: srm://srm.cern.ch/castor/cern.ch/grid/dteam/doe/file1

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Имена файлов в gLite (3/3) Transport URL (TURL) – действительный единообразный идентификатор ресурса (Uniform Resource Identifier, URI) с необходимой информацией для доступа к файлу на SE. Формат: :// Например: gsiftp://tbed0101.cern.ch/data/dteam/doe/file1 где - действительный протокол, поддерживаемый SE, для доступа к содержимому файла (GSIFTP, RFIO, gsidcap); строка после двойной косой черты может иметь любой формат, распознаваемый элементом хранения данных, обсуживающим данный файл. В то время, как SURL, в принципе, является неизменными (это поля в каталоге), TURL динамически получается из SURL через информационную систему или SRM-интерфейс (для тех SE, у которых он есть). TURL может меняться с течением времени и должен считаться действительным только относительно небольшой промежуток времени с момента его получения.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Файловый каталог в gLite (1/3) Пользователям и приложениям необходимо иметь возможность находить файлы в Грид. Файловый каталог (FC) – это сервис, который хранит соответствие между LFN, GUID и SURL. LCG File Catalog (LFC) – это реализация FC в gLite 3. Каталог публикует свой определитель местонахождения (синонимы: единообразный локатор, Uniform Resource Locator, URL) в информационной системе таким образом, что сервис может быть найдет инструментами управления данными и другими сервисами (например, WMS). LFC может использоваться как локальный файловый каталог, хранящий только реплики определенного набора сайтов, так и в качестве Глобального файлового каталога, содержащего информацию о всех файлах в Грид. Последний может иметь множество своих копий только для чтения, которые содержать идентичную информацию и могут быть разнесены по основным компьютерным центрам, тем самым обеспечивая децентрализацию и разгрузку Глобального файлового каталога. LFC предоставляет такие функциональные возможности, как транзакции, сессии, обработку большого количества запросов как одной операции, иерархическое пространство имен для LFN.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Файловый каталог в gLite (2/3) Примечание: файл считается грид-файлом, если он физически присутствует на каком-либо элементе хранения данных И зарегистрирован в файловом каталоге. Существуют определенные высокоуровневые инструменты, которые проверяют согласованность между файлами на SE и соответствующими записями в каталоге. Однако использование низкоуровневых инструментов управления данными может привести к рассогласованию между физическими именами и записями в каталоге, что искажает информацию в Грид. Поэтому использование низкоуровневых инструментов настоятельно НЕ РЕКОМЕНДУЕТСЯ, за исключением случае крайней необходимости.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Свойства LFC Поддержка курсоров для больших запросов Таймауты и повтор запросов от пользователя Транзакции с использованием API Иерархическое пространство имён Единый каталог, где LFN – основной ключ Дальнейшие LFN – как символические ссылки на основное Интегрированная GSI авторизация и аутентификация Поддержка ACL Интеграция с VOMS Поддержка системных метаданных (размер файла, дата создания,…) + поле для пользовательских метаданных База данных: Oracle или MySQL gLite UI File Catalog SE

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Взаимосвязи в LFC GUID Xxxxxx-xxxx-xxx-xxx- System Metadata size => cksum_type => MD5 cksum => yy-yy-yy Symlink /grid/dteam/mydir/mylink Replica srm://host.example.com/foo/bar host.example.com Replica srm://host.example.com/foo/bar host.example.com Replica srm://host.example.com/foo/bar host.example.com Replica srm://host.example.com/foo/bar host.example.com Symlink /grid/dteam/mydir/mylink Symlink /grid/dteam/mydir/mylink LFN /grid/dteam/dir1/dir2/file1.root User metadata User defined string

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для работы с LFC Структура каталогов пространства имён LFC имеет следующий формат: /grid/ / Пользователь конкретной виртуальной организации (ВО) будет иметь права записи и чтения только в соответствующей поддиректории. Политика доступа к поддиректориям более глубокого уровня ( ) реализуется в рамках каждой ВО. Для всех lfc-команд доступны страницы руководства, которые можно просмотреть, выполнив команду $ man где - одна из команд LFC. Большинство этих команд работают подобно их Unix-эквивалентам, но применяются для операций над каталогами и файлами пространства имён LFC. При работе с командами LFC пользователь должен помнить, что операции, которые они выполняют, относятся только к файловому каталогу, а не физическим файлам, представленными в нем соответствующими записями.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Некоторые команды для работы с LFC Полный список команд LFC приведён в источнике [2] в секции LFC commands.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды lfc-ls и lfc-mkdir lfc-ls - команда просмотра содержимого директории в LFC. Она выводит список всех логических имен файлов (LFNs) в указаной директории. ВНИМАНИЕ! -R опцию для вывода рекурсивного списка по всем поддиректориям НЕ рекомендуется часто использовать, т.к. это очень ресурсоёмкая операция для каталога и поэтому её следует избегать. Пример вызова команды lfc-ls: $ lfc-ls /grid/edu generated lfc-mkdir - команда создания директорий в LFC: $ lfc-mkdir /grid/edu/kut $ lfc-ls -l /grid/edu drwxrwxr-x Mar 25 16:11 generated drwxrwxr-x Mar 25 16:18 kut

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команда lfc-ln lfc-ln - команда создания символической ссылки на файл или директорию. Таким образом, два LFN могут указывать на один и тот же объект (файл или директорию). В приведённом ниже примере создается символическая ссылка /grid/edu/kut_symlink на LFN /grid/edu/kut: $ lfc-ln -s /grid/edu/kut /grid/edu/kut_symlink Проверка успешности выполнения предыдущей команды: $ lfc-ls -l /grid/edu/ drwxrwxr-x Mar 25 16:11 generated drwxrwxr-x Mar 25 16:18 kut lrwxrwxrwx Mar 26 15:09 kut_symlink -> /grid/edu/kut

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды lfc-setcomment и lfc-delcomment lfc-setcomment и lfc-delcomment – команды добавления/удаления метаданных (комметариев) к записям в LFC. Например: $ lfc-setcomment /grid/edu/kut " " $ lfc-ls --comment /grid/edu/ generated kut $ lfc-delcomment /grid/edu/kut $ lfc-ls --comment /grid/edu/ generated kut

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команда lfc-rm lfc-rm - команда удаления LFN из файлового каталога. Эта команда может использоваться для удаления файла или директории с пространства имён LFC, но с двумя ограничениями: –файл может быть удалён только при условии, что в файловом каталоге нет связанных с ним SURL'ов. Если SURL существует, тогда для удаления LFN нужно использовать команды из набора lcg_utils (будут описыны дальше); –директория может быть удалена (опция -r) только в том случае, если она пустая. $ lfc-rm /grid/edu/kut_symlink Проверка успешности выполнения предыдущей команды: $ lfc-ls -l /grid/edu/kut_symlink /grid/edu/kut_symlink: No such file or directory

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Список прав доступа LFC позволяет присоединять к файлу или директории список прав доступа (access control list – ACL), т.е. такой список, где указано, кому можно иметь доступ к объекту или модифицировать его. Указание прав очень похоже на то, как это реализовано в Unix-системах: r – read (читать), w – write (записывать), x – execute (исполнять). Комбинация таких прав может быть применена к 1) пользователю (user); 2) группам пользователей (groups); 3) любым другим пользователям (other). В LFC пользователи и группы определяются с помощью числовых виртуальных идентификаторов пользователя или группы (user id – uid, group id – gid), которые виртуальны в том смысле, что они существуют только внутри пространства имён LFC. Пользователя можно указать через его имя, виртуальный идентификатор пользователя (uid) или отличительное имя (Distinguished name, DN). Аналогично для групп пользователей. Каждая директория в LFC имеет ACL-файл, используемый по умолчанию, права в котором применяются для любого файла или поддиректории, создаваемых внутри данной (т.е. права наследуются). После создания объекта внутри директории списки доступа к нему можно изменять.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команда lfc-getacl lfc-getacl – команда получения списка доступа. $ lfc-getacl /grid/edu # file: /grid/edu # owner: root # group: edu user::rwx group::rwx #effective:rwx other::r-x default:user::rwx default:group::rwx default:other::r-x $ lfc-getacl /grid/edu/kut Результат выполнения команды предоставляет информацию об отличительном имени (Distinguished name, DN) и группе владельца директории/файла, а также о текущем и изначальном списках прав доступа.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Операции с файлами и репликами Программное обеспечение промежуточного уровня gLite 3.1 предоставляет широкий набор средств для загрузки/скачивания файлов в/из Грид, репликации (копирования) файлов и взаимодействий с файловым каталогом. Эти средства скрывают от пользователя всю сложность взаимодействия файлового каталога с элементами хранения данных, а также минимизируют риск искажения грид-файлов. Помимо этого, есть низкоуровневые средства для операций с файлами (команды edg-gridftp-*, globus-url-copy, srm-* команды). В некоторых случаях они бывают довольно полезны, но их настоятельно НЕ рекомендуется использовать малоопытным пользователям, т.к. эти низкоуровневые инструменты не проверяют соответствие между файлом на элементе хранения данных и записью в файловом каталоге.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Доступные сервисы для управления данными Прежде, чем выполнять какие-либо операции с данными, необходимо знать, какие сервисы для управления ими (элементы хранения данных и файловый каталог) доступны для вашей виртуальной организации. В gLite 3.1 это можно сделать при помощи утилиты lcg-infosites. $ lcg-infosites --vo edu se Avail Space(Kb) Used Space(Kb) Type SEs n.a n.a vps106.jinr.ru n.a vps108.jinr.ru $ lcg-infosites --vo edu lfcLocal vps104.jinr.ru где –vo – имя виртуальной организации, соответствующая информация о которой запрашивается, se указывает на то, какие данные должны быть выведены (в приведённом выше примере запрашивается информация об элементах хранения данных). lfcLocal обозначает, что информация запрашивается о локальном по отношению к данному интерфейсу пользователя файловому каталогу, обслуживающему указанную ВО.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Некоторые низкоуровневые команды управления данными

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Примеры низкоуровневых команд Перед созданием директории на SE, можно убедиться, что она ещё не существует: $ edg-gridftp-exists gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut error globus_ftp_client: the server responded with an error Эта ошибка означает, что директория не существует. Создание директории на SE: $ edg-gridftp-mkdir gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut Проверка успешности выполнения предыдущей операции: $ edg-gridftp-exists gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut Отсутствие ошибок свидетельствует о том, что директория была создана. Также можно вывести список файлов и директорий: $ edg-gridftp-ls gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu kut Копирование файла с локального диска UI на SE: $ globus-url-copy -vb file:/etc/group \ gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.datfile:/etc/group $ edg-gridftp-ls gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut test_file1.dat

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды взаимодействия с каталогом

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команда lcg-cr Для загрузки файла в Грид (т.е. передачи его с локальной машины на элемент хранения данных с регистрацией этого файла в файловом каталоге) используется команда lcg-cr (cr – сокращение от copy&register), которая после успешного завершения выдаст GUID файла: $ lcg-cr --vo edu -d vps108.jinr.ru file:/etc/group где аргументом является полный путь к файлу на локальной машине, а в опциях –vo указывается виртуальная организация пользователя, -d - элемент хранения данных, на который должен быть скопирован файл. Для указания относительного пути на SE, куда пользователь желает сохранить файл, можно использовать опцию -P: -d -P my_dir/my_file Если опция -P не указана, то путь будет сгенерирован автоматически. Также можно указать полный SURL, включая имя машины SE, путь и желаемое имя файла, но путь должен быть указан в соответствии с виртуальной организацией пользователя.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команда lcg-cr Примеры вызова команды с разным указанием места назначения: $ lcg-cr --vo edu -d srm://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test1 file:/etc/group Проверка успешной записи файла: $ edg-gridftp-exists gsiftp://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test1 Указание относительного пути на SE для записи файла: $ lcg-cr --vo edu -d vps108.jinr.ru -P kut/test_file2.dat file:/etc/group Проверка успешной записи файла: $ edg-gridftp-ls gsiftp://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut Используя опцию -l можно указывать LFN в LFC для копируемого файла. $ lcg-cr --vo edu -d vps108.jinr.ru -P kut/test_file3.dat -l lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn file:/etc/group Примечание: Как уже упоминалось выше, LFN в LFC представлены в виде иерархической структуры, наподобие дерева папок в Unix. Т.е. LFN имеет вид /grid/ /. Поддиректории в пространстве имён НЕ создаются автоматически при выполнении команды lcg-cr и пользователь должен позаботиться самостоятельно о создании нужных поддиректорий заранее (команды lfc-mkdir и lfc-rmdir).

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами После того, как файл был сохранен на SE и зарегистрирован в файловом каталоге, при помощи команды lcg-rep на него можно создать реплики : $ lcg-rep -v --vo edu -d vps106.jinr.ru guid:fa2907ca-f81c-468d-b1c f709f где файл для репликации можно указать через LFN, GUID или SURL, в опции -d указывается SE, на котором должна быть создана копия файла. В качестве места назначения может быть как просто имя машины SE, так и полный SURL, записанный в таком же формате, как и для команды lcg-cr. Команда репликации также допускает использование опции -P для указания относительного пути места назначения. Примечание: Каждый SE может хранить только одну реплику для конкретного GUID. Если пользователь попробует использовать lcg-rep для создания ещё одной копии файла на SE, который уже содержит на него реплику, то команда выполниться успешно, но новая копия файла создана не будет.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами Команда lcg-lr (list replicas) позволяет пользователю получать список всех реплик для файла, зарегистрированного в файловом каталоге. $ lcg-lr guid:fa2907ca-f81c-468d-b1c f709f В качестве аргумента этой команды можно использовать LFN, GUID или SURL. Команда lcg-lg (list GUID) возвращает GUID файла, связанный с указанным LFN или SURL. $ lcg-lg lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn guid:fa2907ca-f81c-468d-b1c f709f Команда lcg-la (list aliases) выводит список всех LFN, относящихся к указанному файлу, который может быть определён через GUID, любое из логических имён файла или SURL одной из его реплик. $ lcg-la srm://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file3.dat lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами Команда lcg-cp (copy) предназначена для копирования файла из Грид на ресурс вне Грида. Первый аргумент (исходный файл) может быть LFN, GUID или SURL. Второй аргумент может быть как локальное имя файла либо действительный TURL. $ lcg-cp -v lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn file:/tmp/test_kut.dat $ ll /tmp/test_kut.dat -rw-rw-r-- 1 kut kut 1092 Apr 2 16:29 /tmp/test1.kut Примечание: хотя эта команда была разработана для копирования файлов из Грид на локальные ресурсы, при правильном указании TURL она может быть использована как для передачи файлов между двумя SE, так и для копирования файла с локальных ресурсов в Грид. Этого НЕ следует делать, потому что будет иметь место такой же эффект, как и в случае с командой lcg-rep, но без регистрации в файловом каталоге, что сделает эту реплику невидимой для грид-пользователей. Примечание: если копирование файла происходит с ленточных запоминающих устройств большой ёмкости (Mass Storage System, MSS), то запрашиваемый файл может отсутствовать на дисковом буфере, а находиться на ленте. По этой причине, копирование файла может закончиться неудачно из-за истечения времени ожидания при выполнении команды, т.к. файл должен быть помещён с ленты в дисковый буфер. Опция -t позволяет менять время ожидания.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами Команда lcg-gt (get TURL) позволяет получить TURL из SURL и поддерживаемый протокол. Результат выполнения этой команды зависит от того, имеет ли SE SRM интерфейс или нет. Но в любом случае, результатом являются три строки, первая из которых всегда TURL, а остальные две (requestID и fileID) имеют значение только, если SE поддерживает SRM. Более подробную информацию можно узнать в [2]. $ lcg-gt srm://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file3.dat gsiftp gsiftp://vps108.jinr.ru/vps108.jinr.ru:/storage/edu/ /test_file3.dat В случае SRM интерфейса, TURL возвращается самим SRM. Если SE является ленточным накопителем, то прежде, чем TURL будет возвращён команде, файл будет скопирован на дисковый буфер, если в момент запроса он на нём отсутствовал. Поэтому выполнение команды lcg-gt может занять довольно продолжительное время, но зато последующий вызов команды lcg-cp с данным TURL начнёт копирование файла немедленно, т.к. он уже будет находиться на дисковом буфере. Это одна из причин, почему SRM интерфейс желательно использовать для всех MSS.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами Файл, сохранённый на SE и зарегистрированный в файловом каталоге, может быть удалён командой lcg-del. Если в качестве аргумента указан SURL, то конкретно эта реплика будет удалена. Если указан GUID или LFN, то нужно указать опцию -s, которая показывает, какая из реплик должна быть удалена. В противном случае используется опция -а, что приводит к удалению всех реплик файла с элементов хранения данных и в файловом каталоге. Если GUID-LFN не имеет реплик в каталоге, такая запись тоже удаляется из файлового каталога.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над репликами $ lcg-lr lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/generated/ /filecff f a4f4- 593b3b9ac1bc srm://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file3.dat $ lcg-del -s vps106.jinr.ru lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn $ lcg-lr lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn srm://vps108.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file3.dat $ lcg-del -a lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn $ lcg-lr lfn:/grid/edu/kut/test3.lfn vps104.jinr.ru: /grid/edu/kut/test3.lfn: No such file or directory lcg_lr: No such file or directory Последнее сообщение об ошибке свидетельствует о том, что LFN больше не зарегистрирован в каталоге,т.к. все реплики были удалены.

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды взаимодействия с каталогом Команда lcg-rf (register file) позволяет зарегистрировать в файловом каталоге физически существующий на SE файл, создавая пару GUID-SURL. Опция -g даёт возможность задать GUID, иначе он будет автоматически сгенерирован. Проверка существования файла на SE: $ edg-gridftp-exists gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat Если файл не существует, то скопируйте его (см. команду globus-url-copy). Проверка, что файл с данным SURL незарегистрирован в файловом каталоге: $ lcg-lr srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat vps104.jinr.ru: srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat: No such file or directory lcg_lr: No such file or directory Регистрация файла в каталоге: $ lcg-rf -l /grid/edu/kut/test_data.lfn srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat guid: b a9e3-358b18fd0020 Проверка успешной регистрации файла в каталоге и его LFN: $ lcg-lr guid: b a9e3-358b18fd0020 srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над алиасами Команда lcg-aa (add alias) позволяет пользователю добавить новый LFN к существующему GUID. Получение GUID, к которому хотим добавить новый LFN: $ lcg-lg lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn guid: b a9e3-358b18fd0020 Проверка существующих LFN для данного GUID: $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn Добавление нового LFN: $ lcg-aa guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_lfn2 Проверка существующих LFN для данного GUID: $ $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn lfn:/grid/edu/kut/test_lfn2

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды для операций над алиасами Команда lcg-ra (remove alias) удаляет LFN для существующего GUID. Проверка существующих LFN для данного GUID: $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn lfn:/grid/edu/kut/test_lfn2 Удаление одного LFN: $lcg-ra guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_lfn2 Проверка существующих LFN для данного GUID: $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 lfn:/grid/edu/kut/test_data.lfn

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды взаимодействия с каталогом Команда lcg-uf (unregister file) удаляет пару GUID-SURL (которым соответствуют первый и второй аргументы команды) в файловом каталоге. Если была удалена последняя реплика файла, то также удаляется и сама пара GUID-LFN. Примечание: данная команда удаляет только соответствующую запись в файловом каталоге, но не удаляет файл с SE физически. Удаление реплики из каталога: $ lcg-uf guid: b a9e3-358b18fd0020 srm://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat b a9e3-358b18fd0020: No such GUID Проверка, что файл с данным GUID незарегистрирован в файловом каталоге: $ lcg-la guid: b a9e3-358b18fd0020 vps104.jinr.ru: b a9e3-358b18fd0020: No such file or directory lcg_la: No such file or directory Проверка, что файл по-прежнему существует на SE: $ edg-gridftp-exists gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat Удаление файла и директории с SE: $ edg-gridftp-rm gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/test_file1.dat $ edg-gridftp-rmdir gsiftp://vps106.jinr.ru/dpm/jinr.ru/home/edu/kut/

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Команды SRM srm-advisory-delete srm_v1 srmmv srm-get-metadata srmcp srmrm srm-get-request-status srmls srmrmdir srm-storage-element-info srmmkdir srmstage

Enabling Grids for E-sciencE EGEE-II INFSO-RI Источники и полезные ссылки 1.Веб-сайт gLitehttp://glite.web.cern.chgLitehttp://glite.web.cern.ch 2.Руководства пользователя gLite