Структурная биология специфических взаимодействий трансмембранных доменов рецепторных тирозинкиназ в норме и патологии Институт биоорганической химии им.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова Российской академии.
Advertisements

Семейства белков- регуляторов транскрипции у эукариот.
Федеральная целевая программа «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технологического комплекса России на.
ПОЛИТЕХНИКИ - ЛУЧШИЕ В КОНКУРСЕ ГРАНТОВ ПРАВИТЕЛЬСТВА САНКТ-ПЕТЕРБУРГА Итоги конкурса 2012 года грантов Комитета по науке и высшей школе Правительства.
Моделирование и расчет кинематики и динамики роботов Fanuc Выполнил: Бахмутский Юрий Александрович Руководитель Громыко Олег Владимирович.
Многомасштабное атомистическое моделирование биосенсорных материалов А.В. Одиноков, А.А. Багатурьянц ЦФ РАН.
Идентификация модели рудно-термической печи с закрытой дугой по экспериментальным данным Аспирант: Елизаров В.А. Научный руководитель: д.т.н., проф. Рубцов.
Разработка методов машинного обучения на основе генетических алгоритмов и эволюционной стратегии для построения управляющих конечных автоматов Второй этап.
Структура и функции биологических мембран Е.Д. Бедошвили Отдел ультраструктуры клетки.
12 апреля 2011 г. Факультет Биоинженерии и Биоинформатики, 2 курс, весенний семестр Функции Мембранные белки. Транспортные белки.
Сумма средств Источник финансирования 2010 г.2011 г.2012 г.2013 г.2014 г. Грант из средств бюджета субъекта федерации Гранты Президента.
Расчет параметров связывания противоопухолевого антибиотика ActII с ДНК методом ДСК РФФ, кафедра медицинской и биологической физики Ткаченко Е.С. Работа.
Экспериме́нт (от лат. experimentum проба, опыт) в научном методе метод исследования некоторого явления в управляемых условиях. Экспериме́нт (от лат. experimentum.
О перспективах развития ведущих университетов Директор Департамента государственной политики в сфере высшего образования Министерства образования и науки.
Инновации в образовании: направления и результаты проектирования участников сети федеральных инновационных площадок (проблемный анализ на материалах отчетов.
Московский Энергетический Институт (Технический Университет) Научный руководитель: д.т.н., проф. Рубцов В.П. Аспирант: Елизаров В.А. 1.
Моделирование в программе Swiss-PDB Viewer NADH:FMN-оксидоредуктаза Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального.
Проект: «Предоставление инструментальных средств поддержки внедрения стажировочными площадками современных моделей успешной социализации детей» в рамках.
1 1 Федеральные государственные образовательные стандарты Приказ Минобрнауки России от «Об утверждении и введении в действие ФГОС основного.
Управление образования администрации муниципального района «Троицко-Печорский» ФГОС дошкольного образования Чечко Л.Н. (главный специалист Управления образования)
Транксрипт:

Структурная биология специфических взаимодействий трансмембранных доменов рецепторных тирозинкиназ в норме и патологии Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова отдел Структурной Биологии Государственный контракт от «1» марта 2011 г в рамках ФЦП «Исследования и разработки по приоритетным направлениям развития научно-технического комплекса России на годы» Научный руководитель проф. А.С.Арсеньев

Программа Preddimer 1. Построение идеальной спирали 2. Расчет поверхности (МГП+ландшафт) 3. Поиск соответствия поверхностей Варьирование α1, α2, φ Расчет F scoring (α1, α2, φ) 4. Итоговые е модели

Предсказание пространственной структуры димеров (МК+МД) 1. Предсказание грубых моделей (неявн ая мембране) 2. Уточнение моделей (МД в полноатомных бислоях) 3. Расчеты свободной энергии ассоциации PreddimerMК+МДСвободная энергия Семейство ErbbВсе модели гомо- и гетеродимеров + гомодимер (Erbb2V659Q) Все гомодимеры Мутанты Erbb1V657Е и Erbb2V659Q Гетеродимеры Erbb1Erbb2 Erbb2Erbb3 + Fgfr3Гомодимеры ТМС дикого типа + мутантов G380R и A391E + Семейство ephAEpha1 и Epha2 + Bnip3++ + GpaДикий тип, мутанты G83I, T87V Дикий тип, мутант T87V

Исследование структуры димеров ТМ-РТК методом ЯМР и МД-релаксации МД-релаксация в явно заданной мембране моделирование аминокислотных замен ЯМР структура в мицеллах или бицеллах ТМ-РТК дикого типа и патогенных форм гетероядерная ЯМР-спектроскопия получение и солюбилизация изотопно-меченых ТМ-РТК

Пространственные структуры димеров ТМ-РТК в мицеллах и бицеллах (отправлены в PDB) ErbB4tm ErbB1tm (EGFR) ErbB3tmFGFR3tm

Исследование термодинамики димеризации ТМ РТК Изменение соотношения липид(детергент)/ТМ-РТК ErbB3 ErbB4

Исследование термодинамики димеризации ТМ РТК ErbB4 Температурная зависимость соотношения мономер-димер

Исследование равновесной кинетики димеризации ТМ доменов РТК

Патогенные мутации в ТМ-FGFR3 ЯМР структура ТМ-FGFR3 димера в мицеллах DPC/SDS альтернативныйв мицеллах DPC/SDS димеризационный интерфейс

String-puppet механизм активации РТК FGFR3 норма патология управляемое переключение в активное состояние дестабилизация неактивной формы или неконтролируемое переключения в активное состояние