Транскриптомика Докладчик: Владимир Тигунцев МБФ, гр Совместное заседание студенческого научного кружка кафедры биохимии и молекулярной биологии и кружка кафедры медицинской и биологической кибернетики «Биохимия и смежные науки» г.

Что такое транскриптомика? Транскриптомика – идентификация всех матричных РНК, кодирующих белки, определение количества каждой индивидуальной мРНК, определение закономерностей экспрессии всех генов, кодирующих белки.

История

Транскриптом – набор всех РНК, находящихся в данном образце. Анализ транскриптома, определение качественного и количественного профиля всех синтезированных РНК, отражает синтез кодируемых ими белков, а так же синтез рибосомальных, транспортных и других РНК.

Задачи и возможности транскриптомики реконструировать коды, заключенные в геноме (кооперация с геномикой); выявлять информацию в виде сигналов и кодов, необходимую для формирования протеома (кооперация с протеомикой).

Методы транскриптомики SAGE ESTs MPSS

ДНК-микрочипы

Транскриптомика кровообращения Анализ транскриптома моноцитов неожиданно показал, что у пациентов, которые перенесли коронарную реваскуляризацию, повышен уровень экспрессии белка онкогена FOS (может вызывать остеосаркому Финкеля- Бискиса-Джинкиса).

Онкотранскриптомика Обнаружены маркерные гены, активирующиеся на ранних стадиях онкогенеза и соответствующие им маркерные белки. Найдены маркеры, позволяющие проводить молекулярную классификацию опухолей, обнаружены предикторы метастазирования, предикторы ответа на терапию, маркеры, позволяющие прогнозировать развитие различных онкозаболеваний.

Перинатальная транскриптомика Ее задачи – путем анализов транскриптомов и протеомов амниотической жидкости и находящихся в ней отшелувшихся клеток плода, а также материнской и пуповинной крови, определять риск спонтанных абортов и патологий развития плода (наследственных, врожденных и др.).

Психиатрическая транскриптомика Это направление занимается выяснением того, какие именно мутации, какие изменения транскриптомов и протеомов характерны для психических расстройств. Определение транскриптомного профиля уже привело к открытию неожиданных связей между изменениями экспрессии определенных генов и психическими растройствами.

Благодарю за внимание!