По мере накопления химической информации роль данных о пространственном геометрическом строении молекул возрастает. Устанавливать его можно как экспериментальными, так и теоретическими методами, а описывать принято либо в декартовой системе координат, либо в естественных (внутренних, молекулярных) переменных. Существует несколько алгоритмов для описания пространного нахождения атомов в молекуле. С появлением компьютерных технологий увеличились возможности в области графических представлений расположения атомов и молекул в пространстве.

ChemSite – создание 3D- моделей молекул ChemSite - достаточно известная программа по химии, которая способна создавать "обьёмные" 3D модели молекул. С помощью программы можно быстро и легко создать структуру любого химического (органического) соединения. Здесь доступно множество инструментов, которые позволяют точно выполнять построение структур, в них входят: аминокислоты, функциональные группы, углеводы, нуклеиновые кислоты и прочие. Любой структурный компонент можно добавить, присоединить к любому атому и вывести показания на экран.

ChemSite – создание 3D- моделей молекул К положительной характеристики программы можно отнести: 1. Многофункциональна 2. Распространяется бесплатно 3. Широкий спектр функций и свойств 4. Имеется руссификатор К отрицательным характеристикам программы можно отнести: 1. Нет возможности сохранения структуры в виде растровых рисунков (.bmp,.jpeg и др.,.gif). 2. Нет информации (справки) по каждой конкретной команде (кнопке).

ChemCraft версия 1.6 ChemCraft - программа визуализатор квантово-химических частиц, которая распознает различные форматы химических данных.

ChemCraft версия 1.6 Плюсы программы: 1. Утилита обладает возможностью чтения и редактирования форматов сделанных в других химических программах. 2. Программа обладает удобным интерфейсом, способна отображать большое количество данных (длина связей, рендеринг молекулярных орбиталей, колебания молекул и др.). 3. Программа поддерживает множество различных стилей, что способствует качественному отображению изображения. 4. С помощью ChemCraft можно редактировать геометрические параметры моделей, а при желании даже создать анимацию в формате gif. 5. Имеется руссификатор Минусы: 1. Распространяется условно бесплатно (ShareWare), т.е. пользователю предлагается ограниченная по возможностям (неполнофункциональная или демонстрационная версия), сроку действия или версия с встроенным блокиратором-напоминанием (NAG) о необходимости оплаты использования программы.

ChemCraft версия 2.0

В следующей версии программы произошел ряд изменений: изменена структура меню, появились такие возможности как просмотр анимации колебаний; графическое представление градиента энергии; визуализацию молекулярных орбиталей в виде изоповерхностей; использование стандартного набора молекулярных фрагментов; «перетаскивание» атомов или фрагментов с помощью мыши; придание молекуле требуемой симметрии; получение качественных 32-битных изображений молекул в различных графических стилях, содержащих требуемые обозначения (надписи, линии и др.), которые легко экспортируются в Word или другой текстовый редактор.

Orbital Viewer версия 1.04 Программа, созданная специально для визуализации орбиталей. Производит построение 3D изображений s, p, d, f - орбиталей для одного или нескольких атомов (задаются квантовые числа). Полученные изображения могут быть сохранены как в собственном формате программы, так и в форматах TIFF, PPM, BMP, AVI и VRML. Распространяется бесплатно. Также имеется руссификатор.

ChemWindow версия 6.0 Наиболее простая программа (с обновлением 2007 года), работает на всех версиях Windows включая NT и 2000, для работы ей достаточно 486-го процессора. ChemWindow одна из самых удобных утилит, которая поможет красиво и удобно проводить презентации по всем аспектам химических исследований. В библиотеку ChemWindow входит 4500 прорисованных органических и фармакологических структур. ChemWindow содержит более 130 иллюстраций и около 250 инженерных символов, которые помогут «оживить» описание эксперимента. Для дополнительного удобства в ChemWindow включили поддержку работы с базами данных Microsoft Access.

ChemWindow версия 6.0 В комплекте с ChemWindow имеется так называемый SymApps, специально разработанный для создания ЗD-моделей. С его помощью можно превратить двумерный объект в трехмерный. SymApps просчитывает, отображает и анимирует симметрию молекул. Вы также сможете создать перемещения по трем основным направлениям и экспортировать полученный «мультик» в AVI-файл, который можно будет запускать независимо от самой программы.

Другие программы: RasMol (FreeWare) Язык интерфейса – английский Avogadro (FreeWare) Язык интерфейса – английский Symyx Draw 3.1 (FreeWare) Язык интерфейса – английский Chemoffice 2008 (FreeWare) Язык интерфейса – английский (154,56 Мб!) XtalDraw 1.0 (FreeWare) Язык интерфейса – русский