ЗАО «Т-Ген» Создание информационно-программных систем для анализа молекулярно-биологической и генетической информации, полученной в результате крупномасштабного секвенирования

Next-generation sequencing Секвенирование прочтение нуклеотидных последовательностей, например геномной ДНК. По сравнению с традиционными технологиями секвенирования, NGS-методы обладают важными отличиями: Массовость (копийность × случайность); Дешевизна ($ / bp). NGS может применяться не только в фундаментальной науке, но также и в медицине, биотехнологии и других областях.

Обработка данных Технологии NGS улучшаются быстрее, чем компьютерные. В настоящий момент можно секвенировать до 200 Gbp за неделю только сырых данных, для простейшего обсчёта которых потребуется ~200 ядрочасов. Кроме этого, нередко даже для близких задач приходится решать технически разные проблемы.

«Т-Ген» задачи Биоинформатика для нужд NGS требует больших вычислительных и прочих IT-ресурсов, а также широкой квалификации персонала. Поэтому для многих организаций намного дешевле и проще будет не создавать и поддерживать специальный отдел, а отдать биоинформатику на аутсорсинг. «Т-Ген» работает в двух направлениях: 1.Адресные биоинформатические услуги; 2.Разработка собственного продукта.

1. Сервисы Геномные анализы: Ресеквенирование и определение полиморфизмов; de novo сборка неизвестных геномов; Метагеномика, оценка бактериальных сообществ. Транскриптомные и эпигеномные анализы: Дифференциальные экспрессия, метилирование ДНК или модификации гистонов; их комбинирование. Также анализы данных, полученных на микроматрицах и индивидуальные проекты.

2. Миссия Разработка систем автоматизации проводимых биоинформатических анализов; Абстрагирование от используемых программ, переход на функциональный уровень; Внедрение специальных техник и новых алгоритмов; Создание единых биологических баз данных, объединяющих исходные, референсные и результирующие данные.