АНАЛИЗ СТЕПЕНИ СТРУКТУРНОЙ И ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ ОДНОТИПНОСТИ ПОЛИВАЛЕНТНОГО ИНГИБИТОРА ПРОТЕАЗ, СОДЕРЖАЩЕГОСЯ В ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЕ ЖИВОТНЫХ, И СОЕВОГО ИНГИБИТОРА.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
ВЗАИМОДЕЙСТВИЕ МИЕЛОПЕРОКСИДАЗЫ С ЭРИТРОЦИТАМИ Магистрант Григорьева Дарья Владимировна Научный руководитель канд. биол. наук Горудко Ирина Владимировна.
Advertisements

Гормоны
КОРРЕКЦИЯ ПОСЛЕДСТВИЙ ТРОМБИНЕМИИ ПРЕПАРАТОМ МЕДВЕЖЬЕГО ЖИРА Выполнил: студент II курса лечебного факультета ХМГМА Галимов Р.Р. Научный руководитель: старший.
ФИЗИОЛОГИЯ СИСТЕМЫ ГЕМОСТАЗА. Общая характеристика системы гемостаза Гемостаз – физиологическая система, которая предупреждает кровопотерю и поддерживает.
ФИЗИОЛОГИЯ СИСТЕМЫ ГЕМОСТАЗА ПОДГОТОВИЛА АС. ТОЛОКОВА Т.И.
Гормоны Гормоны - биологически активные органические вещества, которые вырабатываются железами внутренней секреции и регулируют деятельность органов тканей.
Железа́ орган, функцией которого является производство какого-либо вещества, играющего важную роль в организме. Вещество может выделяться в качестве секрета.
Проект по химии на тему: «Белки». 02 Что такое белки? Белки, или протеины (от греч. «протос» «первый»), это природные органические соединения, которые.
Свертывание крови. Гемофилия.. Свёртывание крови сложный биологический процесс образования в крови нитей белка фибрина, образующих тромбы, в результате.
Биологическое действие ионизирующего излучения В процессах взаимодействия ио­ низирующих излучений с веществом энергия излучений передается атомам и молекулам.
Тема: Биологическая доступность. Относительная биодоступность. Практическое значение этих показателей. Выполнила: Блохина Е.А.534 гр.
Автор: Жданович Елизавета Юрьевна, Кравцова Анастасия Александровна Руководитель: учитель биологии Слинка Светлана Владимировна ГУО «Гимназия г. Дзержинска»
1 Аминокислоты Соединение, которое содержит одновременно и кислотную функциональную группу, и аминогруппу, является аминокислотой.
Подготовили студентки 1 курса гр.313 Васильева Марина и Кобец Елена.
Ферменты Авторы: Ефремова Мария, Иванова Елена Иванова Елена 10 «а» класс. 10 «а» класс.
Элементарный состав живых организмов. Неорганические вещества В состав живых организмов входят те же элементы, которые входят в состав объектов неживой.
Нарушения обмена витаминов © П.Ф.Литвицкий, 2004 © ГЭОТАР-МЕД, 2004.
ОБМЕН ПРОСТЫХ БЕЛКОВ. Переваривание пищевых белков начинается в желудке и завершаеся в тонком кишечнике под действием протеолитических ферментов (пептидгидролаз,
Лекция 2 Физиология крови.. Электрофореграмма сыворотки крови человека фибриноген.
Транксрипт:

АНАЛИЗ СТЕПЕНИ СТРУКТУРНОЙ И ФУНКЦИОНАЛЬНОЙ ОДНОТИПНОСТИ ПОЛИВАЛЕНТНОГО ИНГИБИТОРА ПРОТЕАЗ, СОДЕРЖАЩЕГОСЯ В ПОДЖЕЛУДОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЕ ЖИВОТНЫХ, И СОЕВОГО ИНГИБИТОРА ТРИПСИНА

Протеолиз лежит в основе регуляции важных физиологических процессов организма. Протеолиз осуществляется большим количеством внутри- и внеклеточных протеолитических ферментов. Типичными представителями протеаз являются трипсин, калликреин, тромбин, плазмин, урокиназа, пепсин, дуоденаза. Деятельность протеаз регулируется преимущественно белками- ингибиторами, составляющими мощный антипротеолитический потенциал организма. Ингибиторы встречаются в организмах животных и растений. Предотвращая преждевременную и чрезмерную активность, либо полностью блокируя работу протеолитических ферментов, ингибиторные белки участвуют в механизмах многих сопряженных с протеолизом процессов, таких как свертывание крови, распад фибринового сгустка, активация комплемента и другие. Особую группу белков-ингибиторов животного происхождения составляют серпины. К ним относят гирудин, α 1 -антитрипсин, α 2 -макроглобулин и другие. Особый интерес представляет поливалентный ингибитор протеаз (апротинин), выделенный из органов крупного рогатого скота. Аналоги животных ингибиторов обнаружены у таких растений как табак, горчица, картофель, пшеница, соя и другие. В частности к ним относятся ингибиторы из соевых бобов. К сожалению, вопрос о структурной и функциональной однотипности протеазных ингибиторов, присутствующих в организмах животных и растений, имеет существенные пробелы. Поэтому в качестве объектов сравнения были выбраны поливалентный ингибитор протеаз поджелудочной железы животных (апротинин) и соевый ингибитор трипсина. Кроме того, актуальность данного исследования обусловлена исключительно важной ролью регуляторов протеолиза в функционировании физиологических процессов.

ЦЕЛЬ – анализ степени структурной гомологии и функциональной однотипности апротинина животного происхождения и соевого ингибитора трипсина (СИТ) ЗАДАЧИ: 1) Методами биоинформатики установить степень структурной гомологии, спектр биологической активности и потенциальные молекулы-мишени апротинина и СИТ среди протеаз человека. 2) Определить трипсин-ингибиторную активность апротинина и СИТ в опытах in vitro. 3) Изучить влияние апротинина и СИТ на свертывание крови (протромбиновое время, активированное частичное тромбопластиновое время и тромбиновое время). 4) Определить влияние апротинина и СИТ на фибринолиз (определение времени фибринолиза). 5) Сравнить влияние апротинина и СИТ на агрегацию тромбоцитов (скорость и степень агрегации). 6) Проанализировать влияние апротинина и СИТ на функциональное состояние системы комплемента (гемолитическая активность). 7) Изучить влияние приема изолята соевого белка, содержащего соевый ингибитор трипсина, на общую протеолитическую и трипсин- ингибиторную активности в сыворотке крови людей.

Итоги проекта по отделу ЭЛЕКТРОННЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ БЕЛКОВ Из 49 просмотренных баз данных белков только 8 содержат информацию об апротинине и СИТ. Наиболее информативные базы - Protein Data Bank и UniProt/Swiss-Prot.

ОПРЕДЕЛЕНИЕ СТЕПЕНИ ГОМОЛОГИИ ИНГИБИТОРОВ Рис. 1. Результат подсчета гомологии апротинина (Aprotinin) и СИТ (SBTI). Рис. 2. Результат подсчета гомологии отдельных участков полипептидных цепей апротинина (Aprotinin) и СИТ (SBTI).

ОПРЕДЕЛЕНИЕ СПЕКТРА БИОЛОГИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ Программа показала 4 вида активности для апротинина и 3 для соевого ингибитора. Ингибиторы схожи по 3 видам активности и вероятности их проявления (Drug-Likeness). Согласно программе они являются ингибиторами ренина и ферментов-конвертаз. Произвести поиск молекул-мишеней для исследуемых ингибиторов методами биоинформатики не удалось, по причине отсутствия в свободном доступе необходимых программ. Программа показала 4 вида активности для апротинина и 3 для соевого ингибитора. Ингибиторы схожи по 3 видам активности и вероятности их проявления (Drug-Likeness). Согласно программе они являются ингибиторами ренина и ферментов-конвертаз. Произвести поиск молекул-мишеней для исследуемых ингибиторов методами биоинформатики не удалось, по причине отсутствия в свободном доступе необходимых программ. Рис. 3. Результат определения биологической активности апротинина и СИТ.

Рис. 4. Электронные трехмерные третичные структуры апротинина и СИТ.

ОПРЕДЕЛЕНИЕ ТРИПСИН-ИНГИБИТОРНОЙ АКТИВНОСТИ АПРОТИНИНА И СИТ Рис. 5. Трипсин-ингибиторная активность апротинина (1), СИТ (2), ε-аминокапроновой кислоты (3) и D-лизина (4) в ИЕ на 1 мг вещества. Рис. 6. Трипсин- ингибиторная активность апротинина (1) и СИТ (2) в ИЕ на 1 нмоль вещества.

Показатель ВРЕМЯ В СЕКУНДАХ Контроль Трипсин 0,1 % Апротинин 1 % СИТ 1 % Протромбиновое время 20±0,9 13±0,9 Р 1-2 0,05 31±0,9 Р 1-4

Табл. 2. Влияние апротинина, СИТ и трипсина на АДФ- и Адреналин-инициируемую агрегацию тромбоцитов Установлено, что трипсин повышает, а ингибиторы в равной степени снижают агрегабельность тромбоцитов при всех исследуемых типах агрегации. Контроль (плазма)(1) Плазма + Апротинин (2) Плазма + СИТ (3) Плазма + Трипсин (4) Обратимая (адф) МА Т МА 22±1,8 55±4,7 14±0,9 Р 1-2

ИССЛЕДОВАНИЕ ГЕМОЛИТИЧЕСКОЙ АКТИВНОСТИ КОМПЛЕМЕНТА Рис. 7. Типичные кривые гемолиза в присутствие трипсина и ингибиторов. Система комплемента активируется путем ограниченного протеолиза и мы предполагали, что трипсин может ускорить гемолиз эритроцитов, а ингибиторы наоборот. Однако, внесение трипсина оказало противоположный эффект, возможно за счет разрушения компонентов системы комплемента. Ингибиторы не повлияли на процесс гемолиза вероятно по причине их субстратной специфичности.

ИССЛЕДОВАНИЕ ВЛИЯНИЯ ПРИЕМА ИЗОЛЯТА СОЕВОГО БЕЛКА НА ОБЩУЮ ПРОТЕОЛИТИЧЕСКУЮ И ТРИПСИН-ИНГИБИТОРНУЮ АКТИВНОСТЬ СЫВОРОТКИ КРОВИ ЛЮДЕЙ СИТИзолят Кол-во ингибиторных единиц (ИЕ) на мг вещ-ва 461,3-1,5 Протеолитическая активность (ЕТ/мл) Ингибиторная активность (ИЕ/мл) До приема 0,343±0,010113±3,6 После приема 0,282±0,008137±5,3 После термической обработки в процессе приготовления изолята соевого белка сохранилась активность соевого ингибитора трипсина. Установлено, что прием на протяжении 2 месяцев изолята соевого белка, обладающего антитрипсиновой активностью, сопровождался достоверным снижением общего уровня протеолитической активности на 18% и увеличением уровня трипсин-ингибиторной активности на 22% в сыворотки крови. Табл. 3. Трипсин-ингибиторная активность СИТ и изолята соевого белка Табл. 4. Общая протеолитическая и трипсин-ингибиторная активность сыворотки крови людей, длительно принимавших изолят соевого белка

ВЫВОДЫ 1) Первичные структуры и спектры биологической активности апротинина и СИТ гомологичны in silico. 2) СИТ и апротинин обладают одинаковой трипсин-ингибиторной активностью in vitro. 3) СИТ и апротинин в равной степени препятствуют свертыванию крови, фибринолизу и агрегации тромбоцитов. СИТ замедляет время свертывания, протекающего по внешнему и внутреннему пути, а апротинин – только по внутреннему пути. 4) Оба ингибитора полностью блокируют фибринолиз. 5) Апротинин и СИТ обладают антиагрегационными свойствами. Они не отличаются по силе торможения обратимой, двухфазной, необратимой АДФ-инициируемой и двухфазной адреналин- инициируемой агрегации тромбоцитов. 6) Растворы СИТ и апротинина в концентрациях 0,01-1,0% не влияют на скорость и степень комплемент-зависимого гемолизиса in vitro. 7) 2-хмесячный прием изолята соевого белка, содержащего активный СИТ, снижает общую протеолитическую активность на 18% и увеличивает трипсин-ингибиторную активность на 21% в сыворотке крови.