Какие бывают РНК полимеразы. За что они отвечают. У эукариот есть три различные РНК полимеразы - I, II и III, ответственные за транскрипцию с соответствующих промоторов класс I =гены, кодирующие рибосомальные РНК II =гены, кодирующие матричные РНК и некоторые малые ядерные РНК III =гены, кодирующие транспортные РНК и оставшиеся малые ядерные РНК.

Эукариотические РНК полимеразы не способны сами по себе инициировать транскрипцию. Для этого им необходимы вспомогательные белки - факторы инициации, формирующие совместно с полимеразами преинициаторные комплексы.

Типы транскрипционных факторов Базальные - включают Pol II + GTFs Ко-факторы - взаимодействуют с регуляторами Специфические - связываются с промоторами, энхансерами и сайленсерами - регулируют транскрипцию отдельных генов

Базальные факторы Структура промотора эукариот ТАТА – содержащие ТАТА – не содержащие

Базальные факторы Инициация на ТАТА TFII (Transcription Factors of RNA polymerase II) TFIID (TBP+TAFs) TBP (TATA Binding Protein) TAFs (TATA associated proteins) TFIIA TFIIB TFIIF + RNA polym II TFIIE – activates TFIIH TFIIH – helicase + kinase

Инициация на ТАТА-less промотерах Схемы инициации для ТАТА содержащих и ТАТА- несодержащих промотеров В ТАТА-несодержащих промотерах инициация идет при помощи белков TAFs комплекса TFIID

Базальные факторы

Базальная регуляция TAF1 может связываться с ТАТА узнающей областью TBP Еще один из примеров мимикрии белков TFIIA конкурирует в связывании TBP с TAF1 Также TFIIA стабилизирует комплекс ТBP- ТАТА

Базальная регуляция TBP могут объединяться в гомодимеры, что препятствует их взаимодействию с ДНК TFIIA провоцирует диссоциацию таких TBP-гомодимеров на мономеры

Базальная регуляция Аналогично TAF1, BTAF1 мимикрирует ТАТА, не ингибируя связывание TBP c ДНК Особенностью BTAF1 является способность одного из его доменов индуцировать диссоциацию комплекса TBP-ДНК

NC2 NC 2 cостоит из 2 субъединиц Образует кольцо, блокирующее преинициаторный комплекс Также может быть коактиватором для TATA-несодержащих промоторов По отдельности субъединицы могут быть вовлечены в специфическую транскрипцию

Regulator-assotiated co-factors Адаптеры Модификатор ы хроматина Ко-репрессорыКо-активаторы Ремоделируют нуклеосомы HATs и HDACs

Медиатор. Кто это? Медиатор – мультибелковый комплекс из 20 белков -Роль медиатора – перенос сигнала (как положительного, так и отрицательного) от специфического фактора транскрипции, связанного с энхансером, к РНК-полимеразе II.

Роджер Д. Корнберг Нобелевская премия по химии за 2006 год присуждена Роджеру Д. Корнбергу за фундаментальные исследования молекулярных основ транскрипции у эукариот.

Медиатор.(MED) MED взаимодействует с не фосфорелированной формой С-концевого Домена полимеразы-2.(СTD) MED+СTD=holoenzyme MED взаимодействует с РНК-полимеразой2 Только на стадии инициации. Затем MED отсоединяется. Одна из причин этого – фосфорелирование CTD. Отличается высокой консервативностью От дрожжей до человека.

Структурные части медиатора. Голова(Head)- образует наибольшее количество контактов с полимеразой. Самая консервативная часть. Хвост(Tail) – платформа для взаимодействия с ген -специфическими активаторами. Наименее консервативная часть. Тело(Middle)- соединительная функция