Репарация ДНК 1

Типы повреждений ДНК 1) Повреждения отдельных нуклеотидов Замена одного основания на другое Вставка или делеция оснований Химическая модификация оснований (например, дезаминирование, образование тиминовых димеров, гидролиз N-гликозидной связи) Разрывы одной цепи ДНК 2) Двойные разрывы (=>рекомбинация) 2

Proofreading полимераз Полимеразы II, III (pol gamma, gelta) Проверка правильности нуклеотида перед присоединением следующего 3->5-экзонуклеазная активность 3

Прямая репарация 1) Фотореактивация; 4

Прямая репарация 2) Удаление метильной группы из метилированного основания О- метилгуанина. 5

Репарация неспаренных оснований (mismatch) На примере E.coli: Основные белки: 1)MutS (димер) – связывается с поврежденной цепью, 2)MutL – активирует энзим MutH, 3)MutH – вносит одноцепочечный разрыв и активирует геликазу (UrvD), 4)Геликаза, 5 ->3 и 3->5 экзонуклеазы и полимераза III. Обнаружение поврежденной цепи 6

Репарация неспаренных оснований (mismatch) 7

Особенности эукариот - MSH – гомологи MutS; - MLH – гомологи MutL. Нет гомологов MutH, не распознают неметиллированную цепь Как определяется дочерняя цепь пока точно не известно (существует гипотеза о распозновании дочерней цепи по разрывам между фрагментами Оказаки) 8

Эксцизионная репарация оснований (BER) 9

Ферменты: гликозилаза, полимераза I (pol beta у эукариот), АП-эндонуклеаза, лигаза 10

Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER) Распознает изменение конформации На примере E.coli: Белки: UvrA + UvrB – сканируют ДНК, второй заставляет ДНК образовывать одноцепочечный пузырь вокруг повреждения и активирует UvrC UvrC – делает два надреза Полимераза I и лигаза 11

Эксцизионная репарация нуклеотидов (NER) 12

Репарация двойных разрывов (1): негомологичное соединение концов DNA end joining = Non-homologous end joining (NHEJ) 13

Репарация двойных разрывов (2): пострепликативная репарация Репарация путем рекомбинации 14