UGENE Workflow Designer: вычислительные конвейеры в биоинформатике Грехов Герман Новосибирский центр информационных технологий УНИПРО НГУ, ФИТ.

Презентация:



Advertisements
Похожие презентации
Алгоритмический трейдинг c Python Денис Колодин ген. директор AlgoMarkets LLC Денис Колодин ген. директор AlgoMarkets LLC.
Advertisements

Программная обработка данных. Основной функцией компьютера является обработка информации е годы – вычисление е годы – вычисление 70-е годы.
SharePoint Conference Украина, Киев 25 апреля 2012 На что способен InfoPath? Управление контентом SharePoint с помощью InfoPath Бельский Сергей.
Базы данных: назначение и основные возможности Разработка учителя информатики и ИКТ МОУ СОШ с. Тербуны Болговой Н.А.
Проблемы, с которыми сталкивается разработчик на 1С сегодня Скрипты для Снегопата – инструментальное решение этих проблем Как разрабатываются скрипты?
Расширение интерфейсных возможностей Московец Олег Александрович, Ведущий аналитик ЦИТК «Парус»
ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ Работу выполнили: Дудкина Татьяна Шакурова Лилия.
НГ 001 НГ 002 НГ 003 НГ 004 НГ 005 НГ 006 НГ 007.
Пользовательский интерфейс для NumGRID Руководитель проекта: Городничев М.А. – м.н.с. ИВМ и МГ СО РАН Участники проекта: Пустосмехов Владимир Волков Александр.
ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ ПРОГРАММНОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ ИНФОРМАЦИОННЫХ ТЕХНОЛОГИЙ.
Человеко-машинное взаимодействие Лекция 1 Мерзлякова Екатерина Юрьевна к.т.н. доцент ПМиК.
Составитель: Ташбулатова Н.А. учитель информатики.
Презентация на тему "Программное обеспечение информационных технологий"
ПРОЕКТ СРЕДЫ РАЗРАБОТКИ СПЕЦИАЛИЗИРОВАННЫХ СИСТЕМ ВИЗУАЛИЗАЦИИ П.А. Васёв ИММ УрО РАН, Екатеринбург XII Международный семинар «Супервычисления и математическое.
Специальность «Программное обеспечение вычислительной техники и автоматизированных систем» Ижевск 2009 Мамаев Михаил Владимирович Платформа для.
ПАКЕТ ПРИКЛАДНЫХ ПРОГРАММ БАЗИС т. (3832) Новосибирск, 2002 И.С.Голосов, Н.И.Горбенко, Я.Л.Гурьева, В.П.Ильин,
Программное обеспечение (ПО) – совокупность программ, выполняемых вычислительной системой.
Составление выражений по схемам.. Напишите выражение по схеме. Составьте программу его вычисления и найдите его значение Сложить числа.
Сербис Илья Николаевич ?. Разработчик: кафедра математики и дидактики Университета Байройта (Германия) Идеолог – Альфред Вассерман Разрабатывается:
Облачные технологии для медицины – вопросы безопасности И.А.Трифаленков, начальник отдела ИБ проекта «Информационное общество»
Транксрипт:

UGENE Workflow Designer: вычислительные конвейеры в биоинформатике Грехов Герман Новосибирский центр информационных технологий УНИПРО НГУ, ФИТ

UGENE

Бесплатный Мультиплатформенный (С++, Qt) Тысячи пользователей по всему миру Команда 8-10 человек –Средний возраст

Платформа

Workflow Designer

Более 70 элементов Модель данных Внутренний язык программирования Workflow Designer

Действия над данными Типизация Модель данных

Интерфейс базы данных – СУБД SQLite Модель данных

UGENE Workflow Language (UWL) Dataflow Вычислительные элементы – Конструкции языка – Стандартная библиотека – Библиотека пользователя Синтаксис – Графический – Текстовый

Графический синтаксис

Текстовый синтаксис

Пользовательская библиотека Добавление сторонних инструментов Элементы Javascript

Сторонние программы

Javascript

Визард

Привязан к конкретной схеме Написан на UWL

Распределенные вычисления Перспективы

BOSC13 Интеграция с динамическими языками – Python – Ruby – Node.js

Спасибо за внимание! UGENE*: – – Унипро: – – Герман Грехов: – *[Okonechnikov K.; Golosova O.; Fursov M.; the UGENE team.Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit Bioinformatics : ]