Сравнительные характеристики некоторых технологий выявления генетических полиморфизмов склонности к тромбофилии Ольховский И.А. Красноярский филиал ФГБУ Гематологический научный центр Минздравсоцразвития РФ Субботина Т.Н., Петухова Е.В. Сибирский Федеральный Университет

Реальная практика: надежность генетического тестирования в клинической ПЦР лаборатории Первично сомнительных результатов: от 2,5% (F2) до 22% (PAI-1) Совпадения с результатами арбитражных тестов: от 96% (F7) до 89% (MTHFR) Остаются спорными– 0,5% (PAI-1) Основные проблемы: подготовка персонала и контаминация проб

Сравнение технологий норма Эл. форез РТ ПЦР

ТехнологииЗатратыВыделени е ДНК Амплифик ация Детекция ПЦР –ЭФ (НПФ «Литех»)Стоимость реагентов (руб) 26,128,710,1 Трудозатраты (мин) 2,88,115,2 ПЦР –РТ (НПФ «Литех»)Стоимость реагентов 26,144,5 Трудозатраты 2,84,4 ПЦР –РТ (ООО «Синтол») Стоимость реагентов 42,642,3 Трудозатраты 7,94,4 «ФИБР-БИОЧИП» (ООО Биочип-МПБ») - *одновременная оценка 5 SNP Стоимость реагентов 86,3 Трудозатраты 5,2 Биолюминесцентный тест ИБ СО РАН 1.sh bad find_related.js lib stem_test.js на стадии разработки Стоимость реагентов -23,013,0 Трудозатраты -1,70,8

Аналитический методПолиморфизм генов Количество «элементарных» манипуляций на один окончательный результат РасчетноеРеально выполнено ПЦР (экспресс- выделение, амплификация и ЭФ детекция) MTHFR 2,64,1 PAI-1 2,66,2 F5F5 2,64,4 F7F7 2,63,9 F2F2 2,65,3 ПЦР-РТ (экспресс- выделение, амплификация детекция РТ) MTHFR 1,521,66 F5F5 1,521,62 F2F2 1,521,62

По результатам международного внешнего контроля качества ошибки тестирования SNP в формате ПЦР - от 3% до 15% [Hertzberg М, e.a 2005, External Quality Assurance of DNA Testing for Thrombophilia Mutations] Рекомендуется проведение повторных подтверждающих исследованной (!)

Качество генетического тестирования : требования к лаборатории

Прогностическая значимость

Генетические факторы риска при травмо опасных видах спорта 4 из 63 (6,3%) квалифицированных спортсменов гетерозиготы Лейдена Может ли полиморфизм служить поводом отказа от спортивной карьеры?

Что сдерживает генетический скрининг на тромбофилии? Вероятностный характер прогноза Отсутствие эффективных программ мониторинга и доклинической профилактики развития заболеваний Стоимость тестирования Отсутствие системы гарантий качества результатов

Актуальные вопросы Контроль качества генетического тестирования: разработка «стандартных панелей»; включение в программу ФСВОК Проспективные исследования и клинико- экономический анализ эффективности Национальное руководство по проведению тестирования на генетические маркеры тромбофилий