В том числе - Eubacteria (1043 species), Archaea (84 species)

2010

Estimates of genome sizes, based on data from DOGS

Информация и энтропия Шэнона Определения Информация, связанная с некоторой вероятностью Информация, связанная с сообщением, состоящим из n символов Информация, содержащаяся в одном символе Такое же значение для среднего количества информации в одном символе. символы равновероятны p=1/n символы неравновероятны (информация каждого символа умножается на вес=вероятность встречаемости символа) Энтропия Шэнона:

Энтропия жульнической монеты (вероятность орла 0.75) Энтропия честной монеты Энтропия ДНК с равновероятными частотами ATGC Энтропия ДНК AT- 90%, GC -10%

Матрицы весов (BLOSUM, PAM) Энтропия PAM1 (больше информации) выше, чем PAM120 (менее специфична, меньше информации) Энтропия BLOSUM80 выше, чем BLOSUM62 Тогда относительная энтропия матрицы весов Среднее число битов в одной позиции выравнивания