С 1996 года включен в список наследия ЮНЕСКО.

Монастырь Санаин, расположен в одноименном селе, на небольшом горном плато, у каньона реки Дебед, на высоте 1000 м над уровнем моря. По другую сторону реки находится город Алаверди, дорога от которого до монастыря начинается у древнего Санаинского моста.

Точная дата основания монастыря не установлена. Однако известно, что в X-XI в.

Монастырь занимает небольшую, около 2 га территорию, в центральной части которого, вокруг главного храма Санаина – Сурб Аствацацин – построены церковь Аменапркич и часовня Сурб Григор (X в.), здание академии (XI в.), книгохранилище (1063 г.), здание галереи (конец X в.), притвор (1181 г.) и колокольня (XIII в.).

Между церквами Сурб Аствацацин и Сурб Аменапркич строителями X в. Был оставлен узкий проход. Однако зодчие вскоре убедились в том, что частые землетрясения в этих местах могут разрушить церкви. Ими было принято остроумное и чрезвычайно правильное с инженерной точки зрения решение – заполнить пространство между церквами еще одной постройкой, которая создаст единую объемно-пространственную композицию, что значительно повысит сейсмическую устойчивость всех этих сооружений. Такой постройкой стало помещение Академии. Композиция его представляет каркасную конструкцию однонефной галереи с мощными арками и устоями, перекрытую каменными плитами.

Промежутки между столбами оформлены глубокими арочными нишами: в них, по преданию, располагались слушатели. Книгохранилище - редкое по своему назначению здание, свидетельствующие о высоком уровне развития гражданского зодчества Армении XI-XIII веков. Являясь уникальным по композиции интерьера произведением средневекового армянского зодчества, книгохранилище Санаина оказало влияние на создание разнообразных архитектурных форм гражданского зодчества Армении. Академия - оригинальное произведение гражданского зодчества Армении. Промежутки между столбами оформлены глубокими арочными нишами: в них, по преданию, располагались слушатели. Книгохранилище - редкое по своему назначению здание, свидетельствующие о высоком уровне развития гражданского зодчества Армении XI-XIII веков. Являясь уникальным по композиции интерьера произведением средневекового армянского зодчества, книгохранилище Санаина оказало влияние на создание разнообразных архитектурных форм гражданского зодчества Армении.

Притвор монастыря в Санаине представляет собой аккуратный квадратный зал, великолепно украшенный четырьмя центральными колоннами. Колокольня была последним монументальным сооружением и представляла собой солидную квадратную трехэтажную башню, которая была увенчана шестигранной ротондой.

Богатая усыпальница семейства Захаридов расположена рядом с основным комплексом, а непосредственно за пределами монастыря хорошо сохранилась церковь святого Арутюна XIII века с двускатной кровлей и сводчатым залом.