Молекулярная дифференциация изолятов Phytophthora infestans методом RAPD ПЦР Магистерская диссертация Викторовича В.Н. Научный руководитель: д. б. н.,профессор. - презентация

1 Молекулярная дифференциация изолятов Phytophthora infestans методом RAPD ПЦР Магистерская диссертация Викторовича В.Н. Научный руководитель: д. б. н.,профессор Евтушенков А.Н.

2 Целями данной работы были: молекулярная дифференциация природных изолятов P. infestans методом RAPD ПЦР молекулярная дифференциация природных изолятов P. infestans методом RAPD ПЦР Расчёт коэффициентов генетического сходства между различными штаммами патогена Расчёт коэффициентов генетического сходства между различными штаммами патогена

3 Phytophthora infestans – экономически значимый патоген картофеля во всём мире Оомицет P. infestans является патогеном, вызывающим фитофтороз растений семейства паслёновых; его считают одним из наиболее важных патогенов картофеля во всём мире. Патоген отличается способностью быстро уничтожать целые поля томатов и картофеля. Оомицет P. infestans является патогеном, вызывающим фитофтороз растений семейства паслёновых; его считают одним из наиболее важных патогенов картофеля во всём мире. Патоген отличается способностью быстро уничтожать целые поля томатов и картофеля.

4 Генетический полиморфизм Phytophthora infestans Изучение генетического полиморфизма P. infestans имеет важное прикладное значение, поскольку определение различных генетических особенностей патогена на той или иной территории позволяет выбрать наиболее оптимальный метод контроля заболевания, а также спрогнозировать его распространение Изучение генетического полиморфизма P. infestans имеет важное прикладное значение, поскольку определение различных генетических особенностей патогена на той или иной территории позволяет выбрать наиболее оптимальный метод контроля заболевания, а также спрогнозировать его распространение

5 Методы, применяемые в изучении генетического полиморфизма P. infestans AFLP анализ AFLP анализ RAPD анализ RAPD анализ RFLP анализ RFLP анализ Изучение гаплотипов митохондриальной ДНК Изучение гаплотипов митохондриальной ДНК

6 Штаммы микроорганизмов, использованных в работе В работе были использованы следующие штаммы; P. infestans 3/032, 3/033, ДК1, ДаСК , ДаСК , ЗарСК1. Штаммы любезно предоставлены научно- исследовательским институтом картофелеводства НАНБ. В работе были использованы следующие штаммы; P. infestans 3/032, 3/033, ДК1, ДаСК , ДаСК , ЗарСК1. Штаммы любезно предоставлены научно- исследовательским институтом картофелеводства НАНБ.

7 Методы, использованные в работе Выделение тотальной ДНК из P. infestans Выделение тотальной ДНК из P. infestans Электрофорез молекулярной ДНК в агарозном геле Электрофорез молекулярной ДНК в агарозном геле Полимеразная цепная реакция (RAPD анализ) Полимеразная цепная реакция (RAPD анализ)

8 RAPD – паттерны штаммов P. infestans, полученные с праймерами C12 (А),C13(Б),С5(В) АБВ

9 Коэффициенты генетического сходства,, (нижний треугольник) и количество полиморфных фрагментов (верхний треугольник) между проанализированными штаммами P. infestans

10 Дендрограмма, отражающая филогенетические отношения между штаммами P. infestans ДаСК ЗарСК1 ДаСК ДК1 3/032 3/033

11 Выводы, сделанные в работе Компьютерная программа PAST при изучении филогенетического родства штаммов P. infestans позволяет получать корректные данные, которые подтверждаются данными географического распределения. Компьютерная программа PAST при изучении филогенетического родства штаммов P. infestans позволяет получать корректные данные, которые подтверждаются данными географического распределения. Проанализированные штаммы P. infestans характеризуются высоким уровнем генетического полиморфизма (27,2 – 93,9 %), а также обнаруживают достаточно высокую генетическую разнородность (коэффициенты генетического сходства варьируют от 0, ,881356). Проанализированные штаммы P. infestans характеризуются высоким уровнем генетического полиморфизма (27,2 – 93,9 %), а также обнаруживают достаточно высокую генетическую разнородность (коэффициенты генетического сходства варьируют от 0, ,881356). На основании коэффициентов генетического сходства, и построенной дендрограммы штаммы можно разделить на две группы, в группу 1 включены штаммы P. infestans 3/032, 3/033, ДК1; в группу 2 штаммы ДаСК , ЗарСК1, ДаСК На основании коэффициентов генетического сходства, и построенной дендрограммы штаммы можно разделить на две группы, в группу 1 включены штаммы P. infestans 3/032, 3/033, ДК1; в группу 2 штаммы ДаСК , ЗарСК1, ДаСК

12 Спасибо за внимание!