Скачать презентацию
Идет загрузка презентации. Пожалуйста, подождите
Презентация была опубликована 9 лет назад пользователемМарина Беглова
1 НАЦИОНАЛЬНАЯ АКАДЕМИЯ НАУК БЕЛАРУСИ ИНСТИТУТ ГЕНЕТИКИ И ЦИТОЛОГИИ ИДЕНТИФИКАЦИЯ КУЛЬТИВИРУЕМЫХ В БЕЛАРУСИ СОРТОВ ЯЧМЕНЯ С ПРИМЕНЕНИЕМ SSR АНАЛИЗА А.М. Шимкевич, Н.В. Луханина, О.Г. Давыденко
2 Требования к методу молекулярного маркирования: -повторяемость и воспроизводимость данных, в том числе, в различных лабораториях - высокая разрешающая способность - возможность создания баз данных - доступность методики
3 Требует большого количества ДНК, сложная методика Множество локусов, высокий уровень полиморфизма AFLP Обычно необходимо проведение электрофореза в полиакриламидном геле Простота, небольшое количество ДНК, высокая воспроизводимость SSR Результаты плохо воспроизводимы Простота, относительная дешевизна, возможность анализировать несколько локусов, небольшое количество ДНК RAPD Уровень выявляемого полиморфизма ограничен Ясность, надежность, воспроизводимость RFLP Недостатки ДостоинстваМаркер Достоинства и недостатки основных молекулярных маркеров (по Collard et al., 2005; Powell et al., 1995)
4 Праймер Последовательность (5'->3')Хромосома 1Bmac 0093 F- CGTTTGGGACGTATCAAT R-GGGAGTCTTGAGCCTACTG 2 H 2Bmac 0163 F- TTTCCAACAGAGGGTATTTACG R-GCAAAGCCCATGATACATACA 5 H 3Bmag 0007 F- TGAAGGAAGAATAAACAACCAACA R- TCCCCTATTATAGTGACGGTGTG 7 H 4Bmac 0156 F- AACCGAATGTATTCCTCTGTA R- GCCAAACAACTATCGTGTAC 7 H 5HVM 68 F- AGGACCGGATGTTCATAACG R- CAAATCTTCCAGCGAGGCT 4 H 6Bmag 0507 F- CAACTAGCATACCCAAGCTATA R-ACCCCTATTTCAATAATGGA 7 H 7Bmag 0603 F- ATACCATGATACATCACATCG R-GGGGGTATGTACGACTAACTA 3 H 8EBmac 0701 F- ATGATGAGAACTCTTCACCC R- TGGCACTAAAGCAAAAGAC 4 H 9HVC MA F- GCCTCGGTTTGGACATATAAAG R- GTAAAGCAAATGTTGAGCAACG 7 H 10HVM 74 F- CAGGAAGTCATTGCGTGAG R- TGATCAAGAATGATAACATGG 6 H 11Bmag 0223 F- TTAGTCACCCTCAACGGT R- CCCCTAACTGCTGTGATG 5 H 12Bmag 0606 F- TATTTGTAATGTATGTATGTCCC R- TCATTGGTCCAGATAATACAA 3 H 13Bmac 0316 F- ATGGTAGAGGTCCCAACTG R-ATCACTGCTGTGCCTAGC 6 H Микросателлитные маркеры, используемые в работе ( по Ramsay et al., 2000 )
5 Результаты детектируются на приборе Applied Biosystems Genetic Analyzer 3500
6 Условные обозначения используемых маркеров Название маркера Условное обозначение Bmac 0163A Bmac 0156B EBmac 0701C Bmag 0507D Bmag 0603E Bmag 0606F HVM 68G Bmac 0316H HVM 74I Bmac 0093J Bmag 0007K HVC MAL Bmag 0223M
7 Название сорта Формула генотипа Талер A 147 B 170 C 146 D 148,150 E 118 F 150 G 196 H 171,190 I 195 J 163 Сталы A 145 B 170 C 148 D 146,148 E 135 F 150 G 196 H 165 I 195 J 163 Антьяго A 145 B 170 C 148 D 150,154 E 118 F 150 G 196 H 131 I 197 J 163 Тюрингия A 147 B 140 C 146 D 115 E 118 F 125 G 209 H 13 I 197 J 163 Сябра A 145 B 170 C 148 D 148 E 118 F 150 G 216 H 131 I 197 J 163 Гонар A 145 B 140 C 138, 150 D 148, 150 E 118 F 150 G 199 H 163 I 197 J 161 Атаман A 145 B 170 C 138 D 148 E 118 F 150 G 216 H 131 I 197 J 149,157 Дзiвосны A 145 B 170 C 146 D 148 E 118 F 150 G 223 H 165 I 195 J 167 Стратус A 145, 147 B 140 C 146 D 148 E 135 F 123 G 216 H 163 I 197 J 163 Якуб A 145 B 170 C 148 D 148 E 118 F 150 G 209 H 163 I 197 J 157 Гастинец A 147 B 170 C 150 D 148 E 118 F 123 G 196 H 131 I 205 J 159 Бурштын A 145 B 170 C 146, 148 D 148 E 118 F 125 G 209 H 193 I 197 J 157 Зазерский A 145 B 140 C 146 D 148, 154 E 135 F 150 G 216 H 131 I 195 J 159 Бацька A 154 B 155 C 153 D 153 E 123 F 125 H 127 I 191 J 160 Фэст A 152 B 171 C 120,151 D 151 E 123 F 149 H 160 I 201 J 160 Результаты SSR-анализа сортов ячменя
8 СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ!
Еще похожие презентации в нашем архиве:
© 2024 MyShared Inc.
All rights reserved.