PSI – BLAST Position-Specific Iterated BLAST. PSI – BLAST: назначение для поиска удаленных белков или новых представителей семейств если простой BLAST. - презентация

1 PSI – BLAST Position-Specific Iterated BLAST

2 PSI – BLAST: назначение для поиска удаленных белков или новых представителей семейств если простой BLAST не справляется и много находок "hypothetical protein" и "similar to..."

3 PSI – BLAST: как работает 1 ая итерация : обычный белок - белковый BLAST Построение PSSM на основе множественного выравнивания для последовательностей с E-value

4 PSSM в PSI-Blast: особенности На каждой итерации можно включать / исключать последовательности в PSSM вручную PSSM созданная на основе одной БД может быть использована для поиска по другой БД

5 ПРИМЕР

6 ПРИМЕР Найденные последовательности с E-value0,005

7 ПРИМЕР Новые последовательности с E-value

8 ПРИМЕР Новых последовательностей не прибавилось – поиск сошёлся !