Стандартная запись Swiss-Prot. Стандартные поля: entry, name, origin Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие идентификаторы соответствующей. - презентация

1 Стандартная запись Swiss-Prot

2 Стандартные поля: entry, name, origin Название записи, уникальный идентификатор (ID), предыдущие идентификаторы соответствующей записи, даты первой и последней модификаций, распространенное название белка и его синонимы (EC номер для ферментов), название гена, организм и его таксономия, уровень подтверждения

3 Enzyme (ферменты)

4 NiceZyme View

5 UniProt - Taxonomy

6 Ссылки на статьи, использованные для аннотации

7 Комментарии

8

9 Возможные разделы комментариев

10 Cross-References

11 регистрация

12 3D-Structure (список структур)

13 Reactome - курируемая база знаний биологический путей html

14 GO terms Определение термина, синонимы, родительские (Hierarchy) и дочерние термины, ключевые слова, дата последней модификации Поиск гена или его продукта, BLAST, поиск по GO ID, просмотр онтологии

15

16 Cross-References, Keywords

17 KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes

18 KEGG (pathway viewer)

19 DrugBank

20 UniProt

21

22 Keywords

23 Сервер Expasy

24 Словарь ключевых слов

25 FASTA format Программа FASTA (1988, WR Pearson & DJ Lipman): >(the definition line)_уникальный_ID + короткое описание ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ БЕЛКА (ИЛИ ДНК) В ОДНОБУКВЕННОМ КОДЕ RAW format – без definition line

26 Базы данных Exp.Method Proteins Nucleic Acids Protein/NA Complexes Other Total На PDB

27 Базы данных OCA