МПХИ 20111 Поиск химической информации. МПХИ 20112 «Методология поиска химической информации» «Введение в поиск химической информации» Лекции – 5 занятий. - презентация

1 МПХИ_20111 Поиск химической информации

2 МПХИ_20112 «Методология поиска химической информации» «Введение в поиск химической информации» Лекции – 5 занятий основные несетевые издания возможности поиска химической информации в Интернете, имеющиеся в университете практикум (5 занятий у каждой группы) с 21 февраля Методическое пособие «Поиск химической информации в Интернет- пространстве» на сайте интернет-ю класса химфака – Найти логины и пароли! (интернет-класс, 3 этаж)

3 МПХИ_ MOODLE -модульная объектно- ориентированная динамическая учебная среда свободная система управления обучением (LMS), распространяющаяся по лицензии GNU GPL.свободнаясистема управления обучениемGNU GPL GPL - General Public License иногда переводят, как, например, Универсальная общественная лицензия GNU, GNU - свободная UNIX-подобная операционная системасвободнаяUNIX-подобная операционная система

4 МПХИ_20114 MOODLE – MODULE OBJECT ORIENTED DINAMIC LEARNING EDUCATION

5 МПХИ_20115 I Классификация и примеры основных несетевых справочных и реферативных изданий по химии. Возможности работы с ними и их расположение в Интернете Химические издания (книги, учебники, справочники и т.п.) в Интернете II Некоторые даты из истории возникновения Интернета структура Интернета поисковые сервисы каталоги поисковые системы (ПС) поисковые запросы III Основные правила поиска в ПС: Rambler, Yandex, Yahoo!, Google, Scholar Google, Scirus Применение для поиска УДК, DOI, ISSN, ISBN Система SMILES

6 МПХИ_20116 IIV Сохранение запросов Поиск сокращений и по сокращениям Основные химические журналы и издательства. IV Поиск по структурным формулам Химические базы данных (библиографические, спектральные и др.) Использование социальных сайтов.

7 МПХИ_20117 Количество информации в мире растет: Калифорнийский университет подсчитал, что в 2002 году в мире произведено терабайт информации 1 терабайт – 1024 Гб Для сравнения: объем информации библиотеки Конгресса США, где хранится 19 млн. книг и 56 млн. рукописей – около 10 терабайт информации, то есть в 500 тысяч раз меньше! Ценность и качество!! Объем информации в интернете увеличивается в геометрической прогрессии: 1998 г. – количество web-сайтов – около 1 миллиона 2007 г. - web-сайтов – приближается к 150 миллионам (на май – 50 млн., млн.) web-страниц – 10 миллиардов «синдром информационной усталости»

8 МПХИ_20118 Совокупный объем цифровой информации в 2006 году составил 161 миллиардов гигабайт (161 экзабайт). Указанная цифра (161 млн. ГБ) приблизительно в 3 миллиона раз больше объема информации, содержащейся во всех когда-либо написанных книгах. Если годовой объем информации, созданной человечеством, перевести в формат книг, то получится 12 стопок, каждая из которых превышает расстояние от Земли до Солнца (150 млн. км). По предположениям аналитиков IDC, объем информации, созданной в течение 2010 года, возрастет более чем в шесть раз и составит 988 экзабайт при общем ежегодном росте 57%. Хотя к 2010 году почти 70% цифровой информации будет создаваться отдельными пользователями, компании будут решать вопросы безопасности, конфиденциальности, надежности и соответствия стандартам в отношении 85% информации.

9 МПХИ_ мая, 2009 По прогнозам аналитиков (EMC Corporation), через полтора года количество данных вырастет еще в 2 раза. Это приведет к росту киберпреступности. В настоящее время, по оценкам экспертов, на серверах, подключенных ко Всемирной сети, накопилось 487 экзабайт данных. Это эквивалентно 19 млрд. полностью заполненных оптических дисков Blu-ray или 237 млрд. устройств для чтения Amazon Kindle. серверах, Аналитики подчеркивают, что объем хранящейся в Интернете информации удваивается приблизительно каждые полтора года. По оценкам IDC, к 2012 году суммарный объем контента Всемирной сети увеличится до экзабайт. International Data Corporation

10 МПХИ_ « В жизни, как правило, преуспевает больше других тот, кто располагает лучшей информацией» ( Бенджамин Дизраэли)

11 МПХИ_ Проникновение интернета, млн. чел. Интернет в России в 2010 году

12 МПХИ_201112

13 МПХИ_201113

14 МПХИ_ Информация – 1) сообщение о чем-либо; 2) сведения, являющиеся объектом хранения, переработки и передачи; 3) в математике, кибернетике – количественная мера устранения неопределенности (энтропии), мера организации системы. Неинформированность – сразу означает отставание (Джеймс Уотсон) Чаще всего под термином «химическая информация» понимается совокупность данных, касающихся синтетических и природных химических веществ: - их строение, состав, химические и физико-химические свойства, биологическая активность, нахождение в природе, получение, выделение, очистка, анализ; - их взаимодействие между собой и с другими объектами (физическими и биологическими). Любую информацию нужно уметь: находить, использовать, хранить. Свойства информации – достоверность, полнота, актуальность, ясность, ценность

15 МПХИ_ Предшественники химических справочных изданий Джабир ибн Хайян (арабский алхимик) "Книга семидесяти"изложены химико- металлургические знания того времени Абу-Бакр Муххамед, ибн Закария Ар- Рази(алхимик ) "Книга тайн" и "Книга тайны тайн" Сделана первая попытка классифицировать все известные к тому периоду вещества. Альберт Великий"Книга об алхимии" В. Бирингуччо"О пиротехники" (1540) Первые энциклопедии Г. Агрикола"О горном деле и металлургии" (1556) А. Либавий"Алхимия" (1597). Плиний Старший (23-79)– рукописи 1-4 вв н.э. (гибель Помпеи, 24 авг.79 н.э.) «Естественная история», 37 томов

16 МПХИ_ томные издания, материал располагался по алфавиту: Ruland М, Lexicon Alchemiae, Francofurti,1612; Jоhnson W., Lexicon chymicum, v.1-2, L., ; Масquеr Р., Dictionnaire de chymie..., v , Р., 1766 (русские переводы многих статей с некоторыми изменениями опубликованы в г. в журнале Н. И. Новикова "Магазин натуральной истории, физики и химии". ч ) и др. В. М. Севергин (начало 19 века ) издал сочинение Ш. Каде (Ch. Cadet) "Словарь химический, содержащий в себе теорию и практику химии с приложением ее к естественной истории и искусствам, обработанный на российском языке трудами Василия Севергина" (ч. 1-4, СПБ, ). Первые словари, ( вв.),

17 МПХИ_ ) словари (например, «Словарь органических соединений» под ред. Хейльброна и Бэнбера, ИЛ, 1949 – перевод издания «Dictionary of Organic Compounds», London, 1946), 2) энциклопедии (например, «Химическая энциклопедия»), 3) химический энциклопедический словарь 4) предметные указатели к реферативным журналам «Chemical Abstracts», «Химия». ОСНОВНАЯ СПРАВОЧНАЯ ЛИТЕРАТУРА Формульные справочники – 1) M. Richter Lexicon der Kohlenstoffverbindungen, 2) R. Stelzner Literatur-Register der Organischen Chemie, 3) формульные указатели к реферативным журналам «Chemical Abstracts», «Химия». Алфавитные справочники – например, по классам соединений и другим признакам, например, 1)справочник Бейльштейна (Beilsteins Handbuch der Organischen Chemie). 2) справочное руководство «Химия» (изд. «Химия», Лен. отд., 1975 г.). Справочники, построенные по определенной системе, !!

18 МПХИ_ Формульные справочники: система Рихтера и система Хилла. В брутто-формуле соединения основные элементы располагают в следующем порядке - C, H, O, N, F, Cl, Br, I, S, P ( «химический алфавит»). Остальные элементы располагают в порядке латинского алфавита от A до Z. По формуле выводят химический индекс, который записывают двумя цифрами: первая (арабская) показывает количество атомов углерода в соединении, вторая (римская) – число других элементов в соединении, кроме углерода Рихтера Система Рихтера Хилла Система Хилла углерод водород Все элементы данного соединения расположены в порядке латинского алфавита, исключением являются соединения углерода, то есть органические соединения. В них на первом месте стоит углерод, на втором - водород и лишь после этого располагаются все остальные элементы в алфавитном порядке (латинский алфавит). С 3 H 7 ОN С 7 H 4 OСlBr 3III 7IV С 3 H 7 NО С 7 H 4 BrClO При размещении в справочнике брутто-формул по системе Хилла учитывается вначале число атомов углерода, затем - число атомов водорода и уже после число атомов других элементов в молекуле.

19 МПХИ_ Lancaster (research chemicals, поглощен фирмойAlfa Aesar – реактивы для научных исследований, Великобритания; Германия, работают оба сайта Aldrich (Catalogue Handbook of fine chemicals) –химические реактивы и оборудование Sigma – реактивы для биохимии и исследований в области естественных наук; Supelco – хроматографические продукты для анализа и очистки, хроматографическое оборудование, США; ( Merk – реактивы, диагностика, химикаты; Германия ( и Fluka – Laboratory chemicals and analytical research; Германия ( research chemicals, metals and materials – органические и неорганические соединения, металлы, материалы; (); Strem – metals, inorganic and organometallic for research – металлы, неорганические и металлоорганические реагенты для исследований, США ( «Reference Book of Fine Organics» (Acros Organics) – органические реагенты для научных исследований ( и ) Каталоги коммерческих фирм, Систематизированы по: алфавитному признаку брутто-формулам CAS – регистрационные номера (CAS registry number, Chemical Abstracts) Ссылки на справочник Бейльштейна

20 МПХИ_

21 МПХИ_

22 МПХИ_

23 МПХИ_

24 МПХИ_

25 МПХИ_ Краткая химическая энциклопедия. Пять томов, главный редактор И.Л. Кнунянц, изд-во «Советская энциклопедия», I том вышел в 1961 году. Алфавитные справочники Химическая энциклопедия - переиздание «Краткой химической энциклопедии». I том вышел в 1988 году; изд-во «Советская энциклопедия», состоит из 5 томов. Химический энциклопедический словарь. Содержит краткие сведения о большом количестве химических соединений, процессов, реакций. Практически каждая статья сопровождается библиографической ссылкой. Вышла в 1982 году под ред. И.Л. Кнунянца, изд-во «СЭ ». Справочник химика. Состоит из 6 основных томов и одним дополнительным томом. 2-е изд. – М. – Л. изд. «Химия», 1962 –1968 (под ред. Б.П. Никольского). Т. 1. Общие сведения строение вещества. Свойства важнейших веществ. Лабораторная техника. Т. 2. Основные свойства неорганических и органических соединений. Т. 3. Химическое равновесие и кинетика. Свойства растворов. Электродные процессы. Т. 4. Аналитическая химия. Спектральный анализ. Показатели преломления. Т. 5. Сырье и продукты промышленности неорганических веществ. Процессы и аппараты. Коррозия. Гальванотехника. Т. 6. Сырье и продукты промышленности органических веществ. Т. 7. (Дополнительный) Номенклатура органических соединений. Техника безопасности. Сводный предметный указатель. Enkyklopaidea – круг знаний (греч.)

26 МПХИ_ Новый справочник химика и технолога. Основные свойства органических, неорганических и элементоорганических соединений I том Интеллектуальная собственность. Математический аппарат специалиста. Популярные пакеты прикладных программ. Общие сведения. Строение вещества. Свойства важнейших веществ. Лабораторная техника. II том - Основные свойства органических, неорганических и элементоорганических соединений. III том – Химическое равновесие и кинетика. Свойства растворов. Электродные процессы. Коррозия. 4 приложения. IV том – Аналитическая химия. Часть I и II (дополнительный 1 и 2). Есть ДЕМО-версия V том – Сырье и продукты промышленности неорганических и органических веществ. Часть 1. Сырье и продукт промышленности неорганических веществ. Часть 2 (дополнительный) Сырье и продукты промышленности органических веществ. VI том – Процессы и аппараты химических технологий. Часть 1 и 2 (дополнительный). VII том – Вредные химические вещества. Радиоактивные вещества. Справочник издается в виде твердой копии и на компакт-диске АНО НПО «Профессионал», изд. НПО «Мир и семья», Санкт-Петербург. В настоящее время издано 12 томов ИТХ УрО РАН

27 МПХИ_ КНИГИ В ФОРМАТЕ DJVU или PDF déjà vu djvu - déjà vu – видел раньше Pdf - portable document format – в строке поиска можно задавать фамилию автора книги, часть ее названия, как в русской, так и в английской транскрипции. – тут можно взять программу для чтения этих книг, кроме того, эти программы находятся на предыдущем сайте. portable – портативный переносной Описание электронных библиотек, а также программ для их использования и создания – на сайте – !!! (Bit Lord)

28 МПХИ_ Химия во всех проявлениях – химический портал СhemPort.ru

29 МПХИ_ Реферативный журнал Chemical Abstracts был основан в 1907 году и выпускается Американским химическим обществом. Принятые сокращения: CA, Chem. Abstr. Периодичность издания: до 1962 года журнал выходил 2 раза в месяц, в год 24 журнала, составляющих один том. С 1962 года – выходит 26 журналов в год, объединенных в два тома по 13 номеров в каждом. Первоисточниками для СА служат около 12 тыс. научных и технических журналов на 50 языках, патенты 28 стран, а также материалы конференций, диссертации, книги. Ежедневно пополняемая база данных (приблизительно 14,000 записей каждую неделю). В настоящее время CAS зарегистрировал более 33 миллионов химических соединений РЕФЕРАТИВНЫЕ ЖУРНАЛЫ ПО ХИМИИ. Chemical Abstracts ( Каждый реферат получил порядковый номер, и именно на этот номер (а не на страницу!) даются теперь ссылки в указателях m Nucleophilic aromatic substitution in the pyrrole ring Doddi, Giancarlo; Mencarelli, Paolo; Stegel, Franco (Cent. Stud. Месс. Reazione, Univ. Rоmа, Rome, Italy). J. Chem. Soc., Chem. Соmmun. 1975, (8), (Eng). 2,5 - Dinitro-1-methylpyrrole (I) underwent nucleophilic arom. substitution with piperidine and MeO- to give II and III resp. The ease of these reactions lies in the fact that I bears an N - Ме group rather than N - Н atom which avoids N - Н ionization with strong bases and consequent lowering of the ring reactivity.

30 МПХИ_ Keyword Index - указатель ключевых словKeyword Index - указатель ключевых слов; Patent Index - указатель патентов; Author Index - авторский указатель),Patent Index - указатель патентовAuthor Index - авторский указатель и указатели к каждому тому: Subject Index - предметный указатель; Chemical Substance Index - указатель химических названий; Author Index - авторский указатель; Patent Index - указатель патентов, Formula Index - формульный указатель. Вспомогательные указатели помогают обеспечить поиск по разным признакам и максимально облегчить нахождение нужной информации тем читателям, которые не знакомы со всеми тонкостями терминологии и номенклатуры, применяемой в СА. Указатель циклических систем (Index of Ring System) Путеводитель к указателям (Index Guide)Subject Index - предметный указатель Chemical Substance Index - указатель химических названийAuthor Index - авторский указатель Patent Index - указатель патентов,Formula Index - формульный указатель Вспомогательные указатели Указатель циклических систем Путеводитель к указателям Указатели к Chemical Abstracts ( Важнейшей составной частью СА является широко развитая система указателей. По числу страниц указатели занимают более половины объема издания. Поскольку указатели ради экономии места печатаются очень мелким шрифтом, их действительный объем превосходит объем текста самого СА: на каждые 1000 знаков текста приходится около 3500 знаков в указателях.

31 МПХИ_ CAS системный регистратор - всемирная база данных веществ. CAS – СИСТЕМНЫЙ РЕГИСТРАТОР (CAS REGISTRY) Число добавляемых новых соединений в базу данных CAS Системного реестра выросли, в среднем, от 262,000 в год в первые 5 лет, до более чем 1.3 миллиона в год в самые последние 5 лет. Только за один 1998 год было добавлено более чем 1.7 миллион веществ.

32 МПХИ_ Эти формулы сами по себе не соответствует никакому конкретному соединению, они просто являются удобным способом обозначения химических структур в обобщенном виде. На практике ей может соответствовать большое число конкретных соединений. Формула Маркуша включает один или несколько вариантов заместителей, объединяемых в группу альтернативных структур. Формула Маркуша (Евгений Маркуш, 1923, США) Так 700,000 структур Маркуша представляют 250,000,000 отдельных соединений. Применяется в патентоведении. MeX

33 МПХИ_ Уникальный цифровой идентификатор - CAS Registry Number он приписан только одному единственному веществу он не несет химической информации это мостик к информации об данном конкретном химическом соединении CAS Registry Number содержит до десяти цифр, которые разбиты тире на три группы: Правая группа может содержать до 7 цифр вторая часть – две третья – одну. Последняя правая цифра – проверочная цифра, которая используется для проверки правильности и уникальности номера. Например, это CAS Registry номер для кофеина – морфолин запрос в Google SciFinderSciFinder ( или SciFinder Scholar ( html SciFinder Scholarhttp:// online STN базы данныхonline STN базы данных ( и др.

34 МПХИ_201134

35 МПХИ_ Как можно найти этот номер (CAS number или Registry Number - RN)? Не имея под рукой каталогов Chemical Abstracts, можно воспользоваться услугами Google. Например, при выполнении запросов: или water, CAS Number: water, CAS Number:

36 МПХИ_

37 МПХИ_ РЕФЕРАТИВНЫЙ ЖУРНАЛ ХИМИЯ (РЖ ХИМИЯ) Долгое время на русском языке не было единого реферативного справочника гг. отдельные рефераты помещались в специальном отделе при журнале Русского физико-химического общества гг. выпускался «Химический реферативный журнал», но реферирование было не полным. В 1938 году Академия наук СССР начала выпускать «Химический реферативный журнал», но в нем реферировались только отечественные публикации. В 1941 году журнал прекратил свое существование. В 1950 году выпускался сборник «Химия и химическая технология», где публиковались рефераты из иностранных журналов. С 1953 года началось регулярное реферирование по всем областям химии и стал издаваться реферативный журнал «Химия» (сокращенно РЖХим). Издатель – Всесоюзный институт научной и технической информации Академии наук СССР (ВИНИТИ). ВИНИТИ отражает около одного документов ежегодно, среди которых более 30% поступает из российских источников. Все выпуски РЖ издаются ежемесячно, кроме выпусков по химии и химической технологии (периодичность 2 раза в месяц). Все выпуски РЖ имеют годовые и/или пономерные указатели: авторский, предметный, патентный, указатели источников и специализированные указатели (в некоторых выпусках).

38 МПХИ_ Основные сокращения, применяемые в РЖ Д диссертация, ДП - депонированная рукопись, К книга, КР рецензия на книгу, Р рецензия А Общие вопросы химии. Б Физическая химия. В Неорганическая химия. Комплексные соединения. Г Аналитическая химия. Д Оборудование лабораторий Е Природные органические соединения и их синтетические аналоги Ж Органическая химия И Общие вопросы химической технологии Л Технология неорганических веществ М Силикатные материалы Н Технология органических веществ О Технология органических лекарственных веществ, ветеринарных препаратов и пестицидов. П Химия и переработка древесины, горючих ископаемых и природных газов Р Химия и технология пищевых продуктов, поверхностно-активных материалов и душистых веществ С Химия высокомолекулярных соединений Т Технология полимерных материалов. У Технология полимерных материалов. (Бензин, лакокрасочные материалы и органические покрытия. Вспомогательные материалы для производства полимеров и изделий из них.) Ф Технология полимерных материалов (Природные ВМС. Химические волокна, текстильные материалы. Бумага, Кожа. Мех).

39 МПХИ_ Вид реферата в РЖХимия

40 МПХИ_ РЖХимия в Интернете: 1) (СО РАН)

41 МПХИ_ РЖХимия в Интернете: 2) fuji.viniti.msk.ru (ВИНИТИ)

42 МПХИ_201142

43 МПХИ_ Имя пользователя и пароль

44 МПХИ_ Каталог журналов

45 МПХИ_ РЖ 19Г Реферативный журнал «Аналитическая химия» РЖ 19ГД Реферативный журнал «Аналитическая химия. Оборудование лабораторий» Название журнала

46 МПХИ_201146

47 МПХИ_201147

48 МПХИ_ Г.9 год том РЖ Химия Аналитическая химия Номер реферата Доступ к публикации

49 МПХИ_201149

50 МПХИ_201150

51 МПХИ_201151

52 МПХИ_201152

53 МПХИ_

54 МПХИ_ РЖХимия в Интернете: Воронежский госуниверситет ) Электронные каталоги электронные каталоги реферативные журналы химия

55 МПХИ_ Год, том, номер

56 МПХИ_201156

57 МПХИ_201157

58 МПХИ_201158

59 МПХИ_201159

60 МПХИ_ РЖХимия в Интернете: 4) ssu.samara.ru ssu.samara.ruhttp://www. ssu.samara.ru (Самарский госуниверситет) (Самарский госуниверситет) полнотекстовые БД реферативный журнал ВИНИТИ «ОТКРЫТЬ»

61 МПХИ_ Реферативная библиографическая база данных / Международная ассоциация пользователей и разработчиков электронных библиотек и новых информационных технологий

62 МПХИ_201162

63 МПХИ_201163

64 МПХИ_ «Из тени в свет перелетая, Она сама и тень, и свет. Где родилась она такая, Почти лишённая примет? Она летает, приседая, Она, должно быть, из Китая, Здесь на неё похожих нет, Она из тех забытых лет, Где капля малая лазори Как море синее во взоре море. Она клянется: навсегда! – Не держит слова никогда, Она едва до двух считает, Не понимает ничего, Из целой азбуки читает Две гласных буквы – А и О.О. Ар. Тарковский «Бабочка в госпитальном саду» Наука и Жизнь, 6, 2004 г. АО МММ