МПХИ-20111 II. Поиск химической информации в Интернете: 1.Основные правила поиска в ПС: Rambler, Yandex, Google, Scholar Google, Scirus 2.Сохранение запросов. - презентация

1 МПХИ II. Поиск химической информации в Интернете: 1. Основные правила поиска в ПС: Rambler, Yandex, Google, Scholar Google, Scirus 2. Сохранение запросов 3. Сохранение результатов поиска 4. Система SMILES

2 МПХИ – убийца Google Yahoo – слово придумал Джонатан Свифт (Jonathan Swift) в книге «Путешествия Гулливера». Так звали отталкивающего, омерзительного человека. Основатели «Yahoo!» Джери Янг (Jerry Yang) и Дэвид Фило (David Filo) выбрали это имя, потому что сами себя называли yahooми. Rambler - бродяга Слово «Яndex» означает «Языковой index», или, если по-английски, «Yandex» «Yet Another indexer». Есть и другие толкования. Например, если в слове «Index» перевести с английского первую букву («I» «Я»), получится «Яndex». Google – искаженное написание английского слова googol, придуманного Милтоном Сироттой (племянник американского математика Эдварда Кайзера) для обозначения числа, состоящего из единицы и 100 нулей. Чем больше страниц – тем больше О в слове Google (внизу выдачи)

3 МПХИ-20083

4 4 - краткий справочник языка запросов Yandex

5 МПХИ ) работает в режиме stemming : идти идти, идет, шел, шла окно окон отзывали отозвали Отключение – восклицательный знак впереди термина (!).

6 МПХИ-20086

7 7 2. Чувствителен к регистру. 3. Знаки "+" и " - ". Пишут слитно со вторым термином, иначе эти знаки по умолчанию рассматриваются как И

8 МПХИ-20088

9 9

10 10

11 МПХИ Поиск с расстоянием Часто в запросах ищут устойчивые словосочетания. Если поставить их в кавычки, то будут найдены те документы, в которых эти слова идут строго подряд. Как Яndex адресует слова? Если все слова в тексте перенумеровать по порядку их следования, то расстояние между словами a и b - это разница между номерами слов a и b. Таким образом, расстояние между соседними словами равно 1 (а не 0), а расстояние между соседними словами, стоящими "не в том порядке", равно -1. То же самое относится и к предложениям. 123 «пошел» и «купаться» «купаться» и «пошел» «пошел» и «Веверлей» (1) 2 «Пошелкупатьс я Веверелей »

12 МПХИ Для выполнения между двумя словами поставлен знак '/', за которым сразу напечатано число, указывающее, чтобы расстояние между этими словами не превышало такого числа слов. Запрос бромирование /-2 кислот дает, например, ответ Микроопределение ангидридов кислот непрямым бромированием, а также много результатов на слово бромирование Запрос бромирование /+1 кислот дает тот же результат, как и запрос бромирование кислот, например, В качестве катализатора при бромировании кислот могут и т.д., а также много результатов на первое слово, то есть – бромирование. Запрос бромирование /+2 кислот дает, например, такие результаты - бромирования малеиновой кислоты или полученного при каталитическом бромировании жирных кислот. То есть расстояние между словами запроса составляет одно слово. Запрос бромирование /+3 кислот дает, например, результат бромировании замещенной малоновой кислоты или бромирование О- метилгидроксамовых кислот. А также много результатов на первое слово.

13 МПХИ

14 МПХИ

15 МПХИ

16 МПХИ

17 МПХИ

18 МПХИ

19 МПХИ

20 МПХИ

21 МПХИ

22 МПХИ

23 МПХИ Удобно использовать документные операторы: $title(поисковый запрос) – для поиска только в заголовке, также можно использовать запрос – title: поисковый термин $anchor(поисковый термин) – используется для поиска в тексте ссылок (поисковый термин) << mime=pdf – для поиска документов формата «pdf» или doc, rtf.

24 МПХИ !! «»

25 МПХИ

26 МПХИ Поиск информации на заданном сайте: «поисковый термин» url:адрес сайта/*url:адрес

27 МПХИ

28 МПХИ Google: www2.google.com www3.google.com В настоящее время Google регистрирует ежедневно более 50 млн. поисковых запросов и индексирует более 8 млрд. веб-страниц. Google может находить информацию на 101 языке На конец августа 2004 года поисковая система Google состояла из машин.(источник информации – бывший высокопоставленный сотрудник Компании ) Архитектура Google - shtml Интерфейс Google содержит довольно сложный язык запросов, позволяющий уточнить область поиска отдельными доменами, языками, типами файлов. Краткий справочник по языку запросов на русском языке находится на сайте: Подробное неофициальное описание языка запросов на русском языке с примерами можно найти здесь:

29 МПХИ GOOGLE Выбор ключевых слов 1. Испробовать очевидное – для поиска информации о литии, для начала нужно набрать фразу «литий», а не «щелочные металлы» или «первая группа периодической системы». ( Периодическая система !! ) 2. Для уточнения поиска – можно воспользоваться знаками (+) и (:), например, «литий + содержание в земной коре» или «литий: содержание в земной коре». (Почти такой же результат, если ставить пробел). 3. Синонимы! «Ацетилхлорид», предпочтительнее «хлорангидрида уксусной кислоты», так как во тором случае выпадет много ссылок, касающихся просто «уксусной кислоты» или «хлорангидрида». При поиске информации о «пентаноне-2» лучше еще посмотреть, что получится и при наборе «метилпропилкетон». 3. Нет необходимости включать соединительные союзы между словами, так как Google будет искать все слова, которые Вы написали в поисковой строке 4. Google игнорирует такие слова как «где» и «как», но отвечает на вопрос «что такое ….?», трансформируя Ваш запрос следующим образом – define: название объекта.

30 МПХИ

31 МПХИ Google игнорирует одиночные цифры и буквы. Появление таких знаков в запросе обычно замедляет поиск. Если Вы набрали цифры в поисковой строке, то ниже запросной строки может появиться результат арифметических действий. Например, в Google по CAS индексу можно найти информацию о соединении, которому этот номер принадлежит, это м-аminobenzotrifluoride, одновременно появится следующее: = Чтобы найти запрос в картинках можно воспользоваться основным меню Google, а можно сразу зайти на сайт – ( 7. Если поставить слова запроса в кавычки, тогда Googlе, будет искать эти слова как одну фразу. 8. Google не чувствителен к регистру букв. 9. Если Вы не очень уверены в правильности выбранного Вами Google Web Directory ключевого слова, то можно начать искать в Google Web Directory (каталоги Google). Например, слово «Saturn» найдет Вам ссылки, связанные как с астрономией, так и с автомобилестроением. Поэтому для того, чтобы не менять ключевое слово, лучше сразу зайти в ту директорию, к которой принадлежит нужный вам результат или уточнить запрос.

32 МПХИ

33 МПХИ Альдегиды и кетоны Альдегиды и кетоны относятся к карбонильным органическим соединениям. Карбонильными соединениями называют органические вещества, в молекулах которых имеется... htm - Сохраненная копия - Похожие Сохраненная копия Похожие

34 МПХИ

35 МПХИ Как Google, так и Yandex позволяют в качестве поискового запроса использовать целую фразу – до 35 слов. Например, на запрос: Из средств фонда получено 382,5 тыс. руб., что значительно меньше, чем в 2007 г. (1,0 млн. руб.) и на уровне 2008 г.. Надо отметить, что список грантополучателей РФФИ у нас не расширяется, в отчетном году – 1 тема.

36 МПХИ

37 МПХИ

38 МПХИ В суде Нью-Йорка накануне завершились слушания по делу Google Books - масштабного проекта по сканированию и оцифровке бумажных книг. Однако никакого решения суд не вынес. Как заявил судья Дэнни Чин, необходимо еще "многое обдумать". В суде, где собрались представители почти трех десятков сторон, должна была определиться судьба соглашения между Google, Гильдией авторов США и Ассоциацией американских издателей, в рамках которого поисковая корпорация могла оцифровывать бумажные книги для включения их в свою цифровую библиотеку. Этот документ должен был урегулировать отношения между Google и обладателями авторских прав на бумажные издания, однако его критики заявляют, что таким образом поисковая корпорация станет монополистом на книжном рынке ранее – Google book search Google print

39 МПХИ

40 МПХИ

41 МПХИ

42 МПХИ

43 МПХИ

44 МПХИ Поиск Google может использоваться в пределах одного веб-сайта. Для этого вводят поисковый термин, после него - слово site, двоеточие и название домена:.

45 МПХИ Google Desktop Search Google Desktop Search - программа находится в свободном доступе и её можно найти, набрав словосочетание Google Desktop Search в поисковой строке Google. Установка такой программы в Вашем компьютере позволит Вам находить содержащиеся в нем документы и Ваш компьютер станет меньше напоминать свалку файлов и программ. Методология поиска такая же, как и в поиске на территории веб - пространства Google Desktop Search. После установки программы в компьютере появляется значок -

46 МПХИ

47 МПХИ Проверим, как выполняется в настоящее время запрос при использовании Internet Explorer Mozilla FireFox

48 МПХИ В случае затруднения при переводе можно Воспользоваться on-line переводчиками: (только слова, но очень качественно) Более подробно правила поиска в системе Google можно посмотреть на сайтах ndex.shtml ndex.shtml

49 МПХИ формат искомого документа, для этого в поисковой строке можно набрать следующие команды: термин: pdf (rtf или doc) Google позволяет уточнять

50 МПХИ Подробное описание сервисов (служб) системы Google находится на сайте Интернет энциклопедии Wikipedia: Попасть туда можно, набрав запрос в Google, например, google: wikipedia или зайдя на сайт Википедии, а затем воспользоваться внутренним поиском. Некоторые из сервисов: Google Analytics Google News Google Answers Google Blog Search ( ) Google Book Search ( ) Google Calendar Finance ( Maps Translate ( Калькулятор, конвертер валют, музыка, погода Google Earth – модель планеты земля, созданная при помощи Спутниковых снимков Google Buzz Google Wave

51 МПХИ вариант поисковой системы Google – A chance to stand on the shoulders of giants (Возможность встать на плечи гигантов) Если Я и видел дальше, то только потому, что стоял на плечах гигантов. Исаак Ньютон. If I have seen further, it is by standing on the shoulders of giants. (Isaaс Newton) 1. Чтобы найти статьи, достаточно напечатать фамилию (свою или автора, статью которого Вы ищите). Если таких статьей несколько и Вы знаете соавтора, то можно в поисковой строке набрать: "author:" prefix. Например, Shchepin: Kirillov. 2. Для того чтобы найти статьи данного автора с этим соавтором в какой-то определенной области, можно набрать дополнительно ключевое слово, например: Shchepin:Kirillov reformatsky reaction. 3. При поиске статьи лучше начать с фамилии последнего из авторов статьи, затем добавить несколько ключевых слов, заданных как фраза, то есть в кавычках. Например, author:written "string theory dynamics". author:Abashev ("tetrathiafulvalene")author:written "string theory dynamics" 4. Удобной частью Google Scholar является расширенный поиск (Advanced search). Нажав эту ссылку, Вы увидите таблицу, пользуясь которой можно задать конкретные параметры того издания, которое Вы ищете:

52 МПХИ

53 МПХИ статья на сайте Springer ссылка на статью в аггрегаторе Ingentaconnect ссылка на статью в аггрегаторе Cat.inist.fr статья на сайте Wiley

54 МПХИ

55 МПХИ Scirus. Поисковая система, предназначенная для поиска, главным образом, научной литературы. С недавнего времени в этой системе возможен поиск и на русском языке. Поисковые запросы Написать ключевое слово (слова) или фразу в поисковой строке (язык английский) Можно использовать знаки «+слово» «-слово» или « «слово(а)» » Признает булевы операторы and (acid AND salt - в одном тексте), or (methylbenzene OR toluene - необязательно в одном и том же тексте), andnot (gas ANDNOT helium). Можно сузить область поиска за счет использования сокращений, например: au:author(au:Bryce) ti:title(ti:stereocontrol) jo:journal title (jo:Faraday Transacrions) ke:keywords(ke:extraction) Web – источники –WEB- страницы университетов, научных организаций, ученых, конференций, патентных организаций, торговых компаний и организаций, а также препринты, электронные журналы. Журнальные источники: полнотекстовые статьи журналов, обслуживаемыхScienceDirect, BioMed Cental, PubMed

56 МПХИ

57 МПХИ

58 МПХИ

59 МПХИ

60 МПХИ Сохранение результатов поиска 1. После проведения поиска Вы получаете целый список источников, возможно содержащих нужную Вам информацию. Встает вопрос, как лучше ее сохранить. Вариантов последующего сохранения может быть несколько: a)Документы, найденные Вами со значком pdf, doc, rtf, zip или rar – это шанс получить публикацию в полнотекстовом варианте. Лучше не открывать их сразу в сети: как показывает практика, это сильно замедляет ее работу. Лучше вызвать команду save as («сохранить как») и выполнить действие. Одновременно с этим вы узнаете, действительно ли вам удастся получить полнотекстовый документ.

61 МПХИ Если же при попытке сохранения Вы увидите, что Вам предложено сохранить htm или html документ, то тогда лучше открыть ссылку, так как возможно несколько вариантов: 1) Вы попадаете на страницу, содержащую абстракт найденного документа, на которой находится предложение о получении полнотекстовой статьи – бесплатное (всем или только тем, кто имеет доступ) 2) Вам указана цена статьи; часто при этом есть абстракт этой публикации, но порой и его не бывает, то есть появляются фразы типа Access denied или …is unable to give you access to this content. 3) Вы попадаете на страницу, на которой вам сразу же предложено набрать пароль для дальнейшей работы, например, Authorization Required или Login a password «Авторизация»; «Регистрация» 4) Вам предложено зарегистрироваться, после прохождения регистрации у вас появляется возможность получить доступ к полнотекстовому документу в той или иной форме

62 МПХИ Документы, найденные вами в формате htm, html сохранять можно по- разному, в зависимости от поставленной перед Вами задачи: если нужна только часть текстового содержания полученной страницы, то проще всего выделить нужный абстракт скопировать его в буфер перенести в блокнот затем снова скопировать и перенести в Word. В этом случае остается убрать только некоторые лишние детали. Сразу копировать в Word сложнее, так как это часто требует много времени, памяти (чаще всего копируемая страница или ее часть имеют структуру таблицы) и часто просто «завешивает» компьютер. При сохранении выделенного фрагмента сразу же в Word, конечно же, сохраняется структура документа (цвет, положение отдельных разделов относительно друг друга, иллюстрации). Сразу становится видно табличное построение копируемой страницы.

63 МПХИ полный ТЕКСТ - если нужен полный ТЕКСТ страницы, то можно выбрать команду «сохранить как текст». Сохранение пройдет со всеми последствиями – исчезновение цвета, картинок и т.д. «как веб-страница, только html - при сохранении «как веб-страница, только html» сохраняется только текст, без картинки и рисунков. Форматирование остается тем же, что и на сохраняемой странице; на диск записывается с расширением htm или html; размер файла заметно больше, чем соответствующего текстового файла. web-архив - можно сохранить страницу как web-архив для электронной почты, очень удобно, при раскрытии страница разворачивается так, как она была на сайте, занимает большой объем, но в этом случае всегда Вы попадаете в нужную страницу и можете далее работать в Интернете, используя ее как стартовую. (в FireFox этот тип сохранения отсутствует ) «web-страница, полностью», - при сохранении «web-страница, полностью», сохраненная страница выглядит, как исходная, но все занимает большой объем и сохраняется в виде двух фрагментов - папки и e-файла; чтобы открыть эту странице следует оперировать с е-файлом (имеет расширение html).

64 МПХИ Сравните объемы, занимаемые копированием одного и того же, достаточно незагруженного рисунками сайта: *.txt – 7.01 Kb, *.htm – Kb, *.mht – 107 Kb, web-страница полностью (файл и папка) – 81.6 kB

65 МПХИ СИСТЕМА ОБОЗНАЧЕНИЯ ХИМИЧЕСКИХ СОЕДИНЕНИЙ SMILES и Правила составления кода. Атомы 1) Система обозначения SMILES рассматривает любое химическое соединений как двумерную структуру, то есть так, как оно нарисовано на бумаге. Для написания формул используются символы атомов, обозначения кратности связей, круглые и квадратные скобки и числа для обозначения места открытия и закрытия цикла. 2) Атомы элементов отражаются их обычными символами: С – углерод, N – азот, F – фтор, I – иод, Cl – хлор. O – кислород, P – фосфор и т.д. 3) Очень важен регистр букв! Все алифатические атомы отражаются буквами набранными верхним регистром, тогда как атомы, входящие в ароматические структуры набираются буквами нижнего регистра. 4) При обозначении атомов элементов, имеющих двухбуквенное обозначение, первые буквы символа нужно обязательно набирать верхним регистром. Что касается набора второй буквы, то здесь особой разницы нет, правда, в случае хлора, вторую букву тоже лучше набирать заглавной (CL), так, чтобы не спутать с обозначением единицы (1). 5) За редким исключением, атомы водорода не отражается в кодах SMILES

66 МПХИ Связи. 1) Одинарная связь – чаще всего не показывается или, как обычно, обозначается дефисом « - », например, пропан модно записать как ССС или С-С-С. 2) Двойная связь обозначается знаком «равно», то есть «=», например: Этилен CH2=CH2 C=C ПропиленCH2=CH-CH3 C=CC 2-БутенCH3CH=CH-CH3 CC=CC 3) Тройная связь обозначается знаком #, например, Ацетилен HC CHC#C ПропинCH3C CHC#CC БутинHC CCH2CH3С#CCC АцетонитрилCH3C NСС#N АкрилонитрилCH2=CH-C NC=CC#N 4) Для обозначения ароматического кольца обычно никакие знаки не используются, просто знаки элементов пишут маленькими буквами (нижний регистр) Бензол – с 1 ссссс 1, однако можно и иначе: 1С=СС=СС=С1.

67 МПХИ Разветвление цепи. 1) Разветвление в структуре молекулы отражается в формуле введение скобок, которые чаще всего ставятся после атома, от которого начитается разветвление. Например,

68 МПХИ Отражение циклической структуры 1) Для описания циклических структур требуется использование цифр, которые обозначаются начало и конец цикл, для чего используется один и тот же номер

69 МПХИ

70 МПХИ Использование структурного поиска

71 МПХИ Google: 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine - [ Перевести эту страницу ]Перевести эту страницу SMILES, n1c(cc(nc1N)C)C. International Chemical Identifier (InChI)... CAS Name, 2-amino-4,6-dimethylpyrimidine. Other status information, -... sitem.herts.ac.uk/aeru/.../en/.../945. htm - Сохраненная копия - Похожие Сохраненная копия Похожие

72 МПХИ

73 МПХИ