ИНФОРМАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ ЛЮМИНЕСЦЕНТНОЙ МИКРОСКОПИИ В ЖИВЫХ КЛЕТКАХ Рак С. А. | Яцков Н. Н. | БГУ РФиКТ. - презентация

1 ИНФОРМАЦИОННЫЕ ТЕХНОЛОГИИ В ЭКСПЕРИМЕНТАХ ЛЮМИНЕСЦЕНТНОЙ МИКРОСКОПИИ В ЖИВЫХ КЛЕТКАХ Рак С. А. | Яцков Н. Н. | БГУ РФиКТ

2 ВНУТРИКЛЕТОЧНЫЕ ПРОЦЕССЫ

3 МЕТОДИКИ (FRAP, FLIP) FRAP- эксперимент Область интереса Воздействие лазером

4 СУЩЕСТВУЮЩИЕ МЕТОДЫ Методы моделирования химических реакций реакции Гиллеспи (2001, 2004) (« прямой метод », « метод первой реакции ») и модификации : + Точные стохастические методы - Невозможность учёта пространственных однородностей - Большие вычислительные затраты

5 СУЩЕСТВУЮЩИЕ МЕТОДЫ Методы моделирования FRAP Карреро (2004) и Головатого (2010) + Учёт прямоугольной формы засветки + Разделение на подобласти - Внутри подобластей зависимость только от времени

6 ВЫБОР И ПОСТРОЕНИЕ МОДЕЛИ Объектная модель на основе моделирования поведения отдельных частиц методом Монте - Карло Плюсы : Исследование неоднородностей Удобство визуализации Лёгкая расширяемость Минусы : Большие затраты по памяти и производительности

7 ОГРАНИЧЕНИЯ МОДЕЛИ Диффузия Ассоциация / Диссоциация Полная модель представленная Шпрагом (2004) Произвольная форма засветки

8 АЛГОРИТМ МОДЕЛИРОВАНИЯ

9 ТЕСТИРОВАНИЕ Круглая область засветки

10 ТЕСТИРОВАНИЕ Круглая область засветки ( специфическая неоднородность )

11 ТЕСТИРОВАНИЕ Засветка полосой

12 ВИЗУАЛИЗАЦИЯ

13 ЗАКЛЮЧЕНИЕ Построена и протестирована имитационная модель Модель показывает согласие с существующими математическими моделями Создан удобный интерфейс для работы с моделью

14 БЛАГОДАРЮ ЗА ВНИМАНИЕ