МИТОГЕНОМИКА ПРЕСНОВОДНЫХ РЫБ СЕМЕЙСТВА КАРПОВЫХ (CYPRINIDAE) Луданный Р.И., Хрисанфова Г.Г., Столбунова В.В.*, Слынько Ю.В.*, Рысков А.П., Семенова С.К. - презентация

1 МИТОГЕНОМИКА ПРЕСНОВОДНЫХ РЫБ СЕМЕЙСТВА КАРПОВЫХ (CYPRINIDAE) Луданный Р.И., Хрисанфова Г.Г., Столбунова В.В.*, Слынько Ю.В.*, Рысков А.П., Семенова С.К. Луданный Р.И., Хрисанфова Г.Г., Столбунова В.В.*, Слынько Ю.В.*, Рысков А.П., Семенова С.К. Институт биологии гена РАН , Москва, улица Вавилова д. 34/5. * Институт биологии внутренних вод РАН , пос. Борок, Некоузский район, Ярославская область.

2

3 Carassius auratus L. NC_ Alburnus alburnus L. AB_ Barbus barbus L. AB_ Phoxinus phoxinus L. AP_ Leucisсus soufia L. AY_ Список исследуемых представителей карповых рыб

4 C. сarpio carpio L. (Волжский карп) AY C. сarpio carpio L. (Немецкий карп) AY C. сarpio carpio L. (Yangtze river carp) AY C. сarpio carpio L. (Xingguo carp) AY C. сarpio carpio L. (Qingtian carp) AY C. сarpio carpio L. (Japanese Koi carp) AY C. сarpio carpio L. (Purse red carp) AY C. сarpio carpio L. (Big belly carp) AY C. сarpio carpio L. (Yuanjiang River wild common carp) AY C. сarpio carpio L. (Алтайский карп, чумышская и приобская популяции) Новосибирская область, Россия C. сarpio carpio L. ( Черепетский карп, рамчатый и чешуйчатый) Черепецкая ГЭС, Тульская область, Россия C. сarpio carpio L. (Ропшинский карп, линии ММ и ВВ)Ленинградская область, Россия C. сarpio carpio L. (Ангелинский карп, чешуйчатый и зеркальный)Краснодарский край, Россия C. сarpio carpio L. (Ставропольский карп)Ставропольский край, Россия Список исследуемых пород и видов карпа C. carpio

5 Какова вариабельность контрольного региона у карповых ?Какова вариабельность контрольного региона у карповых ? Как дифференцируются представители семейства карповых по контрольному региону ?Как дифференцируются представители семейства карповых по контрольному региону ?

6 Общая длина CR Количест во идентичн ых сайтов Число нуклеотид ных замен Число замен (%) Abramis brama ,2 Alburus alburnus ,9 Rutilus rubilio ,8 Rutilus rutilus ,7 Leuciscus sofia ,2 Carassius auratus ,7 German mirror carp ,7 Japanese Koi carp ,3 Phoxinus phoxinus ,1 Qingtian carp ,6 Russian carp ,3 Volga carp ,7 Xingguo carp ,3 Yantze river carp ,7 Yuanjiang river carp ,3 Амурский сазан ,3 Венгерский карп ,3 Полиморфизм контрольного региона

7 Количество нуклеотидных замен в доменах Число транзиций и трансверсий в разных доменах контрольного региона

8 Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости в CSB-E домена контрольного региона

9 Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости зоны предполагаемого промотора

10 Какова вариабельность двух митохондриальных генов cox II и cox III у карповых рыб ?Какова вариабельность двух митохондриальных генов cox II и cox III у карповых рыб ? Как дифференцируются представители карповых рыб по этим генам ?Как дифференцируются представители карповых рыб по этим генам ?

11 Транзиции (Тр)Трансверсии (Тв)Тр/ТвТранзиции (Тр)Трансверсии (Тв)Тр/Тв 1 pos14113,238192,0 2 pos214,1932,7 3 pos49252,029143,0 Характеристика нуклеотидного разнообразия (в 1-ом, 2-ом и 3-ем положении кодонов) генов cox II и cox III в исследованной выборке карповых рыб cox II cox III cox II

12 Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III иCR Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III и CR cox II cox III CR

13 Какова скорость накопления мутационных изменений в кодирующих и некодирующих участках мт генома карповых рыб ?Какова скорость накопления мутационных изменений в кодирующих и некодирующих участках мт генома карповых рыб ? Применима ли гипотеза «молекулярных часов» для оценки дивергенции карповых рыб ?Применима ли гипотеза «молекулярных часов» для оценки дивергенции карповых рыб ?

14 27 MY ( Zardoya & Doadrio, 1999 ) V cox II&cox III = 0.35 %/ MY;, V cr = 0.7 %/MY cox II cox III CR Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III иCR Генетическая дифференциация карповых рыб на основании изменчивости генов cox II, cox III и CR

15 Европейский карп Амурский сазан Азиатский карп 0,4 млн. лет назад 0,4 млн. лет назад 1,65 млн. лет назад 1,65 млн. лет назад

16 СПАСИБО ЗА ВНИМАНИЕ