Доклиническая диагностика онкозаболеваний. Биомаркеры рака Шаповал Андрей Иванович, к.б.н. Директор РАПРЦ, профессор кафедры физико-химической биологии и биотехнологии АлтГУ, научный сотрудник университета штата Аризона

Семейная история, BRCA1, BRCA2 HPV 16/18, AFP PSA, CA 125 PML-RARA, BCR- ABL1, CBFB- MHLY11, RUNX1 WNT, MYC, p53 HER2, EGFR, K- RAS, c-Met, PIR3CA, CDK4, FGFR S100 СА 15.3, СА27- 29, САЕ, тиреоглобулин Биомаркеры прогноза Биомаркеры прогноза Биомаркеры рецидива Биомаркеры рецидива Биомаркеры ответа Биомаркеры ответа Насколько агрессивен рак? Вернется ли рак?Будет ли у меня рак? Размер опухоли Порог первичной диагностики Терапия Прогрессия Стабилизация Ответ Порог диагностики рецидива Рецидив Есть ли у меня рак?Работает ли лечение? Какое лечение выбрать?Какой это рак? Биомаркеры риска Биомаркеры риска Биомаркеры скрининга Биомаркеры скрининга Биомаркеры терапии Биомаркеры терапии Биомаркеры диагностики Биомаркеры диагностики Универсальный тест Биомаркеры онкологических заболеваний Определение иммуносигнатур

Идеология универсального теста для биомаркеров - оценка репертуара антител Аллергия Инфекция Опухоль Репертуар циркулирующих антител в сыворотке, ИММУНОСИГНАТУРА, это запись наших взаимодействий с чужеродными антигенами и отражение реакции иммунной системы на эти взаимодействия.

Биомаркеры и антитела Онкомаркер ОЗАнтитела Простата специфический антиген Простата+ Раково-эмбриональный антиген ЖКТ+ CA 125Гинекологические+ СА 15-3МЖ СА 19-9ПЖ Альфа-фетопротеин Печень+ Бета-2-микроглобулин Почки CА 72-4ЖКТ Cyfra-21-1Легкого+ Нейро-специфическая энолаза Нейроэндокринны е Белок S100Меланома HER2МЖ+ p53Различные+ Cyclin B1Различные+ EGFRМЖ+

Иммуносигнатура - immunosignature В отличие от анализа взаимодействий циркулирующих антител с ограниченным числом известных антигенов, иммуносигнатура опирается на мультиплексную систему, в которой тестируются все антитела, находящиеся в крови на данный момент времени. Единичные маркеры (ИФА, ПЦР) Мультиплексные системы (микрочипы)

Микрочип Микроэррей (х 24) точек Каждая точка уникальный пептид Сыворотка Антитела против иммуноглобулинов Принципы определения иммуносигнатур

Разведение (1:500) Обработка микрочипов Образцы крови Сыворотка Сканирование Универсальный тест (иммуносигнатура) Диагностика по капле крови

Replicate 1 Replicate 2 Нормализация и контроль качества Сканирование Иммуносигнатура Выбор пептидов Визуализация результатов иммуносигнатуры Анализ имиджей Оцифрованние результатов Биоинформатика анализ иммуносигнатур

Первый тест РАПРЦ Рак молочной железы Здоровый донор

140 пептидов способны показать различая между сыворотками полеченными от разных доноров. Рак молочной железы Здоровый донор Рак МЖ Здоровый донор

Астроцитома (166) Рак МЖ IV (42) Глиобластома (27)Саркома (20) Олиго/Астро (97) Олигодендроглиома (48)Рак МЖ II, III (141) Доноры без признаков ОЗ (249) Панкреатит (82) Миелома (112) Рак матки (86) Рак легкого (107)Рак поджелудочной железы (136) Долинная лихорадка (142) Рак МЖ Вторичный (61) Иммуносигнатуры различных заболеваний Stafford P. Immunosignature system for diagnosis of cancer. PNAS 2014;111(30):E

Биоинформатика Профилактика База Данных Биобанк Архивирование образцов Геномика Мол. диагностика Протеомик а Immunosignature Лаб-на- микрочипе Lab-On-a-Chip Алтайский филиал РОНЦ Анкета Анамнез Генотип Фенотип Биохимия Другие вкладчики Другие проекты Инфраструктура РАПРЦ Проекты АКОД и РАПРЦ

Спасибо за внимание!

Acknowledgment АлтГУ Землюков СВ Тишкин АА Требухов АВ Подлесных СВ Щербаков ДН Курчанова ЕА АКОД Лазарев АФ Петрова ВД Лазарев СА Пупкова ЕЭ Беленинова ИА Синькина ТВ АГМУ Шойхет ЯН ASU Johnston SA Stafford P Legutki JB ИХБФМ СО РАН Власов ВВ Филипенко МЛ Синяков АН ИКИ СО РАН Козлов ВА «Вектор» Ильичев АА