Комплексное исследование генетических ресурсов флоры юга Западной Сибири Алтайский государственный университет, Южно-Сибирский Ботанический Сад Приват. - презентация

1 Комплексное исследование генетических ресурсов флоры юга Западной Сибири Алтайский государственный университет, Южно-Сибирский Ботанический Сад Приват Доцент, Др. Николай Фризен Университет Оснабрюк, Германия Проект федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России» на годы по лоту : «Проведение научных исследований коллективами под руководством приглашенных исследователей в области биологии, сельскохозяйственных наук и технологии живых систем» 1.2 Выявление видоспецифичных молекулярно-генетических маркеров крупнейших таксонов Исследование направлено на изучение современного состояния научных исследований и получение новых данных в области систематики и филогении ведущих семейств Северной Азии: Ranunculaceae, Rosaceae, Poaceae, Fabaceae, а также ряда хозяйственно важных родов из других семейств (Rhodiola, Allium и др.). В качестве видоспецифичных маркеров предложено использование RAPD, DAF, ISSR, секвенирование ITS фрагмента рибосомальной ДНК, а также создание уникальных праймеров на видоспецифичные участки ДНК. Выявлены недостатки и преимущества разных методик. Для целого ряда видов сконструированы уникальные видоспецифические примеры, позволяющие быстрое и надежное определение видовой принадлежности растительного материала, например в фармакологических сборах и т. п. Задачи исследования: 1.1 Выявление флористического разнообразия сосудистых растений юга Западной Сибири. 1.2 Выявление видоспецифичных молекулярно-генетических маркеров крупнейших таксонов. 1.3 Проведение патентных исследований по темам: «Способ выделения и очистки дезоксирибонуклеиновых кислот», «Способ определения родительских видов для гибридов первого поколения (F1) при спонтанной гибридизации растений», «Тест-системы на основе видоспецифичных ДНК-праймеров». 1.1 Выявление флористического разнообразия сосудистых растений юга Западной Сибири. Определено, что в составе флоpы юга Западной Сибири насчитывается 3135 видов и подвидов сосудистых pастений, относящихся к 733 pодам и 123 семействам. 3. Проведены патентные исследования по темам Систематическая гpуппа Число видовЧисло родовЧисло семейств абс.% % % Плауновые 150,460,643,3 Хвощевые 100,310,110,7 Папоpотниковые 642,0222,21512,3 Голосеменные 170,560,632,4 Покpытосеменные ,869896,510781,3 Табл. 1.1 Соотношение основных таксономических гpупп во флоpе юга Западной Сибири Например: На основании нуклеотидных последовательностей internal transcribed spacer 1, 5.8S ribosomal RNA, internal transcribed spacer 2 были сконструированы следующие, уникальные для Rhodiola rosea L. (Золотой корень, внесенный в официальную фармакопею), видоспецифичные праймеры: FORWARD 5- CGCCAAGGAATCAAAACCGAA-3; REVERSE 5-CGACGGCAGCGACACGCAA-3 Rhodiola rosea в горах Алтая Фото. Н. Фризен Hedisarum neglectum в горах Алтая Фото. Н. Фризен M M Амплификация геномной ДНК с видоспецифичным для Золотого корня примерами. 1- Rh. rosea, 2 – Rh. coccinea, 3-Rh. algida, 4- Rh. quadrifida, 5- Rh. ishidae, 6-Rh. kirilovii. M- Marker 3.1. Способ выделения и очистки дезоксирибонуклеиновых кислот с помощью наноалмазов: Получен Патент и уже внедрен в производство. См. подробности на Способ определения родительских видов для гибридов первого поколения (F1) при спонтанной гибридизации растений Brachanthemum krylovii Dendranthema sinuatum Межродовой гибрид Brachanthemum baranovii Hippolitia megacephala Brachanthemum baranovii клон1 Brachanthemum baranovii клон7 Brachanthemum krylovii клон7 100 Brachanthemum baranovii клон3 Brachanthemum krylovii клон1 Brachanthemum baranovii клон8 Brachanthemum baranovii клон Brachanthemum baranovii клон6 Dendranthema sinuatum клон4 Dendranthema sinuatum клон7 Dendranthema sinuatum клон6 Brachanthemum baranovii клон Дендрограмма сравнения клонированных фрагментов ITS показывает, что ITS B. baranovii содержат ITS-фрагменты от обоих родителей. Метод: Проведена расшифровка и сравнительный анализ участков ядерной (ITS) и хлоропластной (trnL-интрон) ДНК изучаемых, а также родственных им, видов. Для установления гибридного происхождения использовался метод клонирования ITS- фрагментов