Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров. - презентация

1 Microarray gene expression profiling analysis combined with bioinformatics in multiple sclerosis К. Федоров

2 Рассеянный склероз

3 Методика Данные: профиль экспрессии генов при рассеянном склерозе Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) – база знаний по систематическому анализу функций генов – pathway UCSC – transcription factors NCBI – chromosome annotation information

4 Инструменты differentially coexpressed genes and links (DCGL) package in R Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery (DAVID) Regulatory impact factor:

5 Результаты (1) Найдены зависимости между 42-мя транскрипционными факторами и соответствующим им 243-м генам Найдены транскрипционные факторы, оказывающие наибольшее влияние на экспрессию генов при рассеянном склерозе

6 Результаты (2) Отношение между 5-ю транскрипционными факторами и соответствующими им генами Определены основные метаболитические пути, соответствующие использованному профилю экспрессии генов

7 Спасибо за внимание